Protein–RNA interactions for Protein: P56394

Cox17, Cytochrome c oxidase copper chaperone, mousemouse

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox17P56394 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox17P56394 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox17P56394 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox17P56394 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox17P56394 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox17P56394 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cox17P56394 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cox17P56394 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cox17P56394 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cox17P56394 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cox17P56394 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cox17P56394 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cox17P56394 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cox17P56394 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cox17P56394 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cox17P56394 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cox17P56394 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cox17P56394 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cox17P56394 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cox17P56394 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cox17P56394 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cox17P56394 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cox17P56394 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cox17P56394 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cox17P56394 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cox17P56394 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cox17P56394 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cox17P56394 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cox17P56394 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox17P56394 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox17P56394 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox17P56394 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox17P56394 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox17P56394 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox17P56394 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox17P56394 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox17P56394 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox17P56394 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox17P56394 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cox17P56394 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cox17P56394 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cox17P56394 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox17P56394 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox17P56394 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox17P56394 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox17P56394 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox17P56394 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox17P56394 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox17P56394 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox17P56394 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox17P56394 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox17P56394 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox17P56394 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox17P56394 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox17P56394 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox17P56394 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox17P56394 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox17P56394 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox17P56394 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox17P56394 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox17P56394 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox17P56394 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox17P56394 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox17P56394 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox17P56394 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox17P56394 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox17P56394 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox17P56394 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox17P56394 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox17P56394 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox17P56394 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox17P56394 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox17P56394 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox17P56394 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox17P56394 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox17P56394 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox17P56394 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox17P56394 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox17P56394 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox17P56394 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox17P56394 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox17P56394 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox17P56394 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox17P56394 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox17P56394 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox17P56394 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox17P56394 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox17P56394 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox17P56394 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox17P56394 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox17P56394 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox17P56394 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox17P56394 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox17P56394 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox17P56394 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox17P56394 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox17P56394 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox17P56394 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cox17P56394 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cox17P56394 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms