Protein–RNA interactions for Protein: P54099

Polg, DNA polymerase subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolgP54099 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PolgP54099 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PolgP54099 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PolgP54099 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PolgP54099 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PolgP54099 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PolgP54099 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PolgP54099 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PolgP54099 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PolgP54099 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PolgP54099 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PolgP54099 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PolgP54099 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PolgP54099 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PolgP54099 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PolgP54099 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PolgP54099 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PolgP54099 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PolgP54099 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PolgP54099 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PolgP54099 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PolgP54099 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PolgP54099 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PolgP54099 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PolgP54099 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PolgP54099 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PolgP54099 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PolgP54099 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PolgP54099 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PolgP54099 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PolgP54099 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PolgP54099 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PolgP54099 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PolgP54099 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PolgP54099 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PolgP54099 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PolgP54099 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PolgP54099 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PolgP54099 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PolgP54099 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PolgP54099 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PolgP54099 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PolgP54099 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PolgP54099 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PolgP54099 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PolgP54099 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PolgP54099 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PolgP54099 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PolgP54099 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PolgP54099 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PolgP54099 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PolgP54099 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PolgP54099 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PolgP54099 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PolgP54099 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PolgP54099 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PolgP54099 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PolgP54099 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PolgP54099 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PolgP54099 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PolgP54099 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PolgP54099 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PolgP54099 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PolgP54099 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PolgP54099 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PolgP54099 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PolgP54099 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PolgP54099 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PolgP54099 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PolgP54099 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PolgP54099 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PolgP54099 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PolgP54099 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PolgP54099 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PolgP54099 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PolgP54099 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PolgP54099 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PolgP54099 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PolgP54099 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PolgP54099 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PolgP54099 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PolgP54099 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PolgP54099 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PolgP54099 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PolgP54099 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PolgP54099 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PolgP54099 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PolgP54099 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PolgP54099 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PolgP54099 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PolgP54099 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PolgP54099 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PolgP54099 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PolgP54099 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PolgP54099 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PolgP54099 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PolgP54099 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PolgP54099 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PolgP54099 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PolgP54099 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms