Protein–RNA interactions for Protein: P52019

Sqle, Squalene monooxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SqleP52019 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SqleP52019 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SqleP52019 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SqleP52019 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SqleP52019 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SqleP52019 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SqleP52019 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SqleP52019 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SqleP52019 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SqleP52019 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SqleP52019 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SqleP52019 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SqleP52019 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SqleP52019 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SqleP52019 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SqleP52019 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SqleP52019 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SqleP52019 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SqleP52019 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SqleP52019 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SqleP52019 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SqleP52019 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SqleP52019 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SqleP52019 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SqleP52019 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SqleP52019 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SqleP52019 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SqleP52019 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SqleP52019 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SqleP52019 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SqleP52019 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SqleP52019 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SqleP52019 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SqleP52019 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SqleP52019 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SqleP52019 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SqleP52019 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SqleP52019 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SqleP52019 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SqleP52019 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SqleP52019 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SqleP52019 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SqleP52019 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SqleP52019 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SqleP52019 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SqleP52019 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SqleP52019 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SqleP52019 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SqleP52019 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SqleP52019 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SqleP52019 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SqleP52019 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SqleP52019 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SqleP52019 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SqleP52019 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SqleP52019 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SqleP52019 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SqleP52019 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SqleP52019 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SqleP52019 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SqleP52019 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SqleP52019 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SqleP52019 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SqleP52019 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SqleP52019 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SqleP52019 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SqleP52019 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SqleP52019 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SqleP52019 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SqleP52019 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SqleP52019 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SqleP52019 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SqleP52019 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SqleP52019 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SqleP52019 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SqleP52019 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SqleP52019 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SqleP52019 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SqleP52019 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SqleP52019 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SqleP52019 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SqleP52019 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SqleP52019 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SqleP52019 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SqleP52019 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SqleP52019 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SqleP52019 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SqleP52019 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SqleP52019 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SqleP52019 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SqleP52019 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SqleP52019 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SqleP52019 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SqleP52019 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SqleP52019 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SqleP52019 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SqleP52019 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SqleP52019 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SqleP52019 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SqleP52019 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms