Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ApodP51910 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ApodP51910 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ApodP51910 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ApodP51910 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ApodP51910 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ApodP51910 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ApodP51910 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ApodP51910 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ApodP51910 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ApodP51910 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ApodP51910 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ApodP51910 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ApodP51910 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ApodP51910 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ApodP51910 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ApodP51910 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ApodP51910 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ApodP51910 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ApodP51910 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ApodP51910 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ApodP51910 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ApodP51910 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ApodP51910 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ApodP51910 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ApodP51910 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ApodP51910 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ApodP51910 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ApodP51910 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ApodP51910 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ApodP51910 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ApodP51910 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ApodP51910 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ApodP51910 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ApodP51910 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ApodP51910 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ApodP51910 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ApodP51910 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ApodP51910 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ApodP51910 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ApodP51910 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ApodP51910 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ApodP51910 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ApodP51910 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ApodP51910 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ApodP51910 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ApodP51910 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ApodP51910 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ApodP51910 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ApodP51910 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ApodP51910 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ApodP51910 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ApodP51910 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ApodP51910 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ApodP51910 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ApodP51910 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ApodP51910 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ApodP51910 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ApodP51910 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ApodP51910 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ApodP51910 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ApodP51910 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ApodP51910 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ApodP51910 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ApodP51910 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ApodP51910 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ApodP51910 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ApodP51910 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ApodP51910 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ApodP51910 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ApodP51910 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ApodP51910 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ApodP51910 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ApodP51910 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ApodP51910 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ApodP51910 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ApodP51910 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ApodP51910 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ApodP51910 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ApodP51910 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ApodP51910 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ApodP51910 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ApodP51910 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ApodP51910 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ApodP51910 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ApodP51910 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ApodP51910 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ApodP51910 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ApodP51910 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ApodP51910 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ApodP51910 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ApodP51910 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ApodP51910 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ApodP51910 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ApodP51910 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ApodP51910 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ApodP51910 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ApodP51910 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ApodP51910 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ApodP51910 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms