Protein–RNA interactions for Protein: P48318

Gad1, Glutamate decarboxylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gad1P48318 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gad1P48318 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gad1P48318 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gad1P48318 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gad1P48318 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gad1P48318 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gad1P48318 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gad1P48318 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gad1P48318 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gad1P48318 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gad1P48318 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gad1P48318 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gad1P48318 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gad1P48318 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gad1P48318 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gad1P48318 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gad1P48318 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gad1P48318 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gad1P48318 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gad1P48318 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gad1P48318 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gad1P48318 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gad1P48318 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gad1P48318 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gad1P48318 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gad1P48318 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gad1P48318 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gad1P48318 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gad1P48318 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gad1P48318 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gad1P48318 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gad1P48318 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gad1P48318 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gad1P48318 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gad1P48318 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gad1P48318 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gad1P48318 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gad1P48318 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gad1P48318 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gad1P48318 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gad1P48318 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gad1P48318 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gad1P48318 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gad1P48318 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gad1P48318 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gad1P48318 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gad1P48318 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gad1P48318 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gad1P48318 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gad1P48318 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gad1P48318 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gad1P48318 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gad1P48318 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gad1P48318 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gad1P48318 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gad1P48318 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gad1P48318 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gad1P48318 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gad1P48318 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gad1P48318 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gad1P48318 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gad1P48318 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gad1P48318 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gad1P48318 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gad1P48318 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gad1P48318 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gad1P48318 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gad1P48318 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gad1P48318 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gad1P48318 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gad1P48318 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gad1P48318 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gad1P48318 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gad1P48318 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gad1P48318 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gad1P48318 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gad1P48318 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gad1P48318 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gad1P48318 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gad1P48318 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gad1P48318 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gad1P48318 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gad1P48318 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gad1P48318 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gad1P48318 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gad1P48318 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gad1P48318 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gad1P48318 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gad1P48318 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gad1P48318 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gad1P48318 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gad1P48318 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gad1P48318 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gad1P48318 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gad1P48318 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gad1P48318 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gad1P48318 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gad1P48318 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gad1P48318 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gad1P48318 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms