Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pax7P47239 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pax7P47239 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pax7P47239 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pax7P47239 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pax7P47239 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pax7P47239 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pax7P47239 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pax7P47239 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pax7P47239 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pax7P47239 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pax7P47239 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pax7P47239 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pax7P47239 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pax7P47239 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pax7P47239 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pax7P47239 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pax7P47239 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pax7P47239 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pax7P47239 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pax7P47239 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pax7P47239 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pax7P47239 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pax7P47239 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pax7P47239 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pax7P47239 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pax7P47239 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pax7P47239 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pax7P47239 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pax7P47239 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pax7P47239 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pax7P47239 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pax7P47239 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pax7P47239 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pax7P47239 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pax7P47239 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pax7P47239 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Pax7P47239 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Pax7P47239 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pax7P47239 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pax7P47239 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pax7P47239 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pax7P47239 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pax7P47239 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pax7P47239 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pax7P47239 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pax7P47239 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pax7P47239 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pax7P47239 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pax7P47239 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pax7P47239 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pax7P47239 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pax7P47239 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pax7P47239 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pax7P47239 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pax7P47239 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pax7P47239 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pax7P47239 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pax7P47239 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pax7P47239 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pax7P47239 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pax7P47239 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pax7P47239 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pax7P47239 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pax7P47239 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pax7P47239 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pax7P47239 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pax7P47239 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pax7P47239 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pax7P47239 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pax7P47239 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pax7P47239 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pax7P47239 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pax7P47239 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pax7P47239 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pax7P47239 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pax7P47239 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pax7P47239 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pax7P47239 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pax7P47239 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pax7P47239 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pax7P47239 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pax7P47239 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pax7P47239 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Pax7P47239 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pax7P47239 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pax7P47239 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pax7P47239 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Pax7P47239 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pax7P47239 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pax7P47239 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pax7P47239 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pax7P47239 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pax7P47239 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pax7P47239 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pax7P47239 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pax7P47239 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pax7P47239 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pax7P47239 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pax7P47239 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms