Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtgfrP43117 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtgfrP43117 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtgfrP43117 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtgfrP43117 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtgfrP43117 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtgfrP43117 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtgfrP43117 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtgfrP43117 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtgfrP43117 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtgfrP43117 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtgfrP43117 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtgfrP43117 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtgfrP43117 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtgfrP43117 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PtgfrP43117 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtgfrP43117 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtgfrP43117 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PtgfrP43117 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtgfrP43117 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtgfrP43117 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtgfrP43117 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtgfrP43117 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtgfrP43117 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtgfrP43117 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtgfrP43117 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PtgfrP43117 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtgfrP43117 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtgfrP43117 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtgfrP43117 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtgfrP43117 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtgfrP43117 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtgfrP43117 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtgfrP43117 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtgfrP43117 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtgfrP43117 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtgfrP43117 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtgfrP43117 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtgfrP43117 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtgfrP43117 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtgfrP43117 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtgfrP43117 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtgfrP43117 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtgfrP43117 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtgfrP43117 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtgfrP43117 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtgfrP43117 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtgfrP43117 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtgfrP43117 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtgfrP43117 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtgfrP43117 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtgfrP43117 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtgfrP43117 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtgfrP43117 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtgfrP43117 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtgfrP43117 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtgfrP43117 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtgfrP43117 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtgfrP43117 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtgfrP43117 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtgfrP43117 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtgfrP43117 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtgfrP43117 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtgfrP43117 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PtgfrP43117 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtgfrP43117 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtgfrP43117 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtgfrP43117 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtgfrP43117 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtgfrP43117 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtgfrP43117 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtgfrP43117 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtgfrP43117 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PtgfrP43117 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtgfrP43117 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtgfrP43117 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtgfrP43117 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtgfrP43117 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtgfrP43117 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtgfrP43117 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtgfrP43117 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtgfrP43117 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtgfrP43117 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtgfrP43117 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtgfrP43117 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtgfrP43117 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtgfrP43117 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtgfrP43117 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtgfrP43117 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PtgfrP43117 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtgfrP43117 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtgfrP43117 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtgfrP43117 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtgfrP43117 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtgfrP43117 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtgfrP43117 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtgfrP43117 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtgfrP43117 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtgfrP43117 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtgfrP43117 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152 ms