Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nkx2-5P42582 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nkx2-5P42582 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nkx2-5P42582 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nkx2-5P42582 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nkx2-5P42582 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nkx2-5P42582 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nkx2-5P42582 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nkx2-5P42582 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nkx2-5P42582 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nkx2-5P42582 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nkx2-5P42582 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nkx2-5P42582 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nkx2-5P42582 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nkx2-5P42582 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkx2-5P42582 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkx2-5P42582 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkx2-5P42582 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nkx2-5P42582 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nkx2-5P42582 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nkx2-5P42582 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nkx2-5P42582 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nkx2-5P42582 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nkx2-5P42582 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nkx2-5P42582 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nkx2-5P42582 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nkx2-5P42582 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nkx2-5P42582 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nkx2-5P42582 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nkx2-5P42582 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nkx2-5P42582 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nkx2-5P42582 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nkx2-5P42582 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nkx2-5P42582 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nkx2-5P42582 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nkx2-5P42582 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nkx2-5P42582 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nkx2-5P42582 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nkx2-5P42582 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nkx2-5P42582 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nkx2-5P42582 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nkx2-5P42582 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nkx2-5P42582 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nkx2-5P42582 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nkx2-5P42582 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nkx2-5P42582 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nkx2-5P42582 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nkx2-5P42582 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nkx2-5P42582 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx2-5P42582 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx2-5P42582 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx2-5P42582 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx2-5P42582 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx2-5P42582 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx2-5P42582 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nkx2-5P42582 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nkx2-5P42582 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nkx2-5P42582 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nkx2-5P42582 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nkx2-5P42582 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nkx2-5P42582 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nkx2-5P42582 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nkx2-5P42582 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nkx2-5P42582 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nkx2-5P42582 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nkx2-5P42582 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nkx2-5P42582 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nkx2-5P42582 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nkx2-5P42582 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx2-5P42582 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx2-5P42582 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkx2-5P42582 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkx2-5P42582 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkx2-5P42582 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkx2-5P42582 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkx2-5P42582 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkx2-5P42582 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkx2-5P42582 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nkx2-5P42582 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nkx2-5P42582 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nkx2-5P42582 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nkx2-5P42582 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nkx2-5P42582 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nkx2-5P42582 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nkx2-5P42582 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nkx2-5P42582 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Nkx2-5P42582 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nkx2-5P42582 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nkx2-5P42582 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nkx2-5P42582 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nkx2-5P42582 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nkx2-5P42582 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nkx2-5P42582 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nkx2-5P42582 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nkx2-5P42582 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nkx2-5P42582 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nkx2-5P42582 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nkx2-5P42582 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nkx2-5P42582 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkx2-5P42582 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms