Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lig1P37913 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lig1P37913 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lig1P37913 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Lig1P37913 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lig1P37913 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lig1P37913 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lig1P37913 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lig1P37913 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lig1P37913 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lig1P37913 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lig1P37913 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lig1P37913 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lig1P37913 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lig1P37913 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lig1P37913 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lig1P37913 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lig1P37913 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lig1P37913 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lig1P37913 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lig1P37913 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lig1P37913 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lig1P37913 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lig1P37913 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lig1P37913 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lig1P37913 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lig1P37913 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lig1P37913 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lig1P37913 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lig1P37913 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lig1P37913 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lig1P37913 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Lig1P37913 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lig1P37913 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lig1P37913 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lig1P37913 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lig1P37913 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lig1P37913 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lig1P37913 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lig1P37913 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lig1P37913 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lig1P37913 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lig1P37913 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lig1P37913 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lig1P37913 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lig1P37913 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lig1P37913 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lig1P37913 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lig1P37913 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lig1P37913 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Lig1P37913 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lig1P37913 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lig1P37913 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Lig1P37913 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Lig1P37913 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Lig1P37913 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lig1P37913 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lig1P37913 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lig1P37913 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Lig1P37913 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lig1P37913 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lig1P37913 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lig1P37913 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lig1P37913 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lig1P37913 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lig1P37913 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lig1P37913 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lig1P37913 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lig1P37913 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lig1P37913 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Lig1P37913 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lig1P37913 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lig1P37913 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lig1P37913 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lig1P37913 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lig1P37913 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lig1P37913 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lig1P37913 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lig1P37913 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lig1P37913 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lig1P37913 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lig1P37913 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lig1P37913 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lig1P37913 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lig1P37913 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lig1P37913 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lig1P37913 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lig1P37913 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lig1P37913 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lig1P37913 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lig1P37913 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lig1P37913 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lig1P37913 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Lig1P37913 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lig1P37913 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lig1P37913 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lig1P37913 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Lig1P37913 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Lig1P37913 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lig1P37913 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms