Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PpargP37238 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PpargP37238 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PpargP37238 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PpargP37238 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PpargP37238 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PpargP37238 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PpargP37238 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PpargP37238 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PpargP37238 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PpargP37238 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PpargP37238 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PpargP37238 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PpargP37238 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PpargP37238 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PpargP37238 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PpargP37238 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PpargP37238 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PpargP37238 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PpargP37238 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PpargP37238 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PpargP37238 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PpargP37238 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PpargP37238 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PpargP37238 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PpargP37238 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PpargP37238 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PpargP37238 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PpargP37238 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PpargP37238 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PpargP37238 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PpargP37238 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PpargP37238 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PpargP37238 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PpargP37238 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PpargP37238 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PpargP37238 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PpargP37238 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PpargP37238 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PpargP37238 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PpargP37238 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PpargP37238 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PpargP37238 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PpargP37238 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PpargP37238 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PpargP37238 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PpargP37238 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PpargP37238 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PpargP37238 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PpargP37238 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PpargP37238 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PpargP37238 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PpargP37238 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PpargP37238 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PpargP37238 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PpargP37238 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PpargP37238 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PpargP37238 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PpargP37238 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PpargP37238 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PpargP37238 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PpargP37238 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PpargP37238 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PpargP37238 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PpargP37238 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PpargP37238 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PpargP37238 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PpargP37238 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PpargP37238 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PpargP37238 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PpargP37238 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PpargP37238 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PpargP37238 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PpargP37238 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PpargP37238 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PpargP37238 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PpargP37238 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PpargP37238 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PpargP37238 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PpargP37238 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PpargP37238 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PpargP37238 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PpargP37238 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PpargP37238 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PpargP37238 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PpargP37238 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PpargP37238 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PpargP37238 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PpargP37238 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PpargP37238 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PpargP37238 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PpargP37238 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PpargP37238 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PpargP37238 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PpargP37238 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PpargP37238 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PpargP37238 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PpargP37238 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PpargP37238 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PpargP37238 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms