Protein–RNA interactions for Protein: P35385

Hspb7, Heat shock protein beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspb7P35385 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hspb7P35385 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hspb7P35385 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hspb7P35385 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hspb7P35385 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hspb7P35385 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hspb7P35385 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hspb7P35385 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hspb7P35385 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hspb7P35385 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hspb7P35385 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hspb7P35385 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hspb7P35385 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hspb7P35385 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hspb7P35385 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hspb7P35385 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hspb7P35385 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hspb7P35385 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hspb7P35385 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hspb7P35385 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hspb7P35385 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hspb7P35385 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hspb7P35385 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hspb7P35385 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hspb7P35385 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hspb7P35385 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hspb7P35385 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hspb7P35385 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hspb7P35385 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hspb7P35385 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hspb7P35385 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hspb7P35385 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hspb7P35385 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hspb7P35385 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hspb7P35385 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hspb7P35385 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hspb7P35385 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hspb7P35385 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hspb7P35385 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hspb7P35385 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hspb7P35385 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hspb7P35385 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hspb7P35385 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hspb7P35385 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hspb7P35385 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hspb7P35385 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hspb7P35385 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hspb7P35385 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hspb7P35385 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hspb7P35385 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hspb7P35385 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hspb7P35385 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hspb7P35385 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hspb7P35385 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hspb7P35385 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hspb7P35385 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hspb7P35385 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hspb7P35385 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspb7P35385 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspb7P35385 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspb7P35385 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspb7P35385 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspb7P35385 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspb7P35385 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspb7P35385 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspb7P35385 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspb7P35385 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspb7P35385 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspb7P35385 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspb7P35385 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspb7P35385 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspb7P35385 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspb7P35385 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspb7P35385 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspb7P35385 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspb7P35385 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspb7P35385 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspb7P35385 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspb7P35385 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspb7P35385 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspb7P35385 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspb7P35385 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hspb7P35385 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hspb7P35385 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hspb7P35385 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hspb7P35385 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hspb7P35385 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hspb7P35385 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hspb7P35385 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hspb7P35385 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hspb7P35385 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hspb7P35385 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hspb7P35385 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hspb7P35385 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hspb7P35385 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hspb7P35385 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hspb7P35385 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Hspb7P35385 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hspb7P35385 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hspb7P35385 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.3 ms