Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mmp13P33435 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mmp13P33435 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mmp13P33435 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mmp13P33435 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mmp13P33435 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Mmp13P33435 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mmp13P33435 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mmp13P33435 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mmp13P33435 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mmp13P33435 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mmp13P33435 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mmp13P33435 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mmp13P33435 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mmp13P33435 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mmp13P33435 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mmp13P33435 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mmp13P33435 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mmp13P33435 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mmp13P33435 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mmp13P33435 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mmp13P33435 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Mmp13P33435 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mmp13P33435 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mmp13P33435 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mmp13P33435 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mmp13P33435 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mmp13P33435 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mmp13P33435 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mmp13P33435 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mmp13P33435 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mmp13P33435 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mmp13P33435 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mmp13P33435 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mmp13P33435 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mmp13P33435 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mmp13P33435 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mmp13P33435 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mmp13P33435 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mmp13P33435 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mmp13P33435 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mmp13P33435 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mmp13P33435 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Mmp13P33435 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Mmp13P33435 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mmp13P33435 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mmp13P33435 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mmp13P33435 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mmp13P33435 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mmp13P33435 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mmp13P33435 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mmp13P33435 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mmp13P33435 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mmp13P33435 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mmp13P33435 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mmp13P33435 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mmp13P33435 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mmp13P33435 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mmp13P33435 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mmp13P33435 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mmp13P33435 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Mmp13P33435 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mmp13P33435 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mmp13P33435 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mmp13P33435 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mmp13P33435 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mmp13P33435 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mmp13P33435 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mmp13P33435 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mmp13P33435 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mmp13P33435 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mmp13P33435 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mmp13P33435 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mmp13P33435 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mmp13P33435 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mmp13P33435 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mmp13P33435 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mmp13P33435 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mmp13P33435 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mmp13P33435 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Mmp13P33435 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Mmp13P33435 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mmp13P33435 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mmp13P33435 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mmp13P33435 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mmp13P33435 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mmp13P33435 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mmp13P33435 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mmp13P33435 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mmp13P33435 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mmp13P33435 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp13P33435 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp13P33435 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp13P33435 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp13P33435 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp13P33435 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp13P33435 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mmp13P33435 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mmp13P33435 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mmp13P33435 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms