Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gjb1P28230 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Gjb1P28230 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gjb1P28230 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gjb1P28230 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gjb1P28230 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gjb1P28230 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Gjb1P28230 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gjb1P28230 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gjb1P28230 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gjb1P28230 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Gjb1P28230 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gjb1P28230 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gjb1P28230 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gjb1P28230 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gjb1P28230 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gjb1P28230 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gjb1P28230 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gjb1P28230 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gjb1P28230 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gjb1P28230 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gjb1P28230 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gjb1P28230 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gjb1P28230 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gjb1P28230 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gjb1P28230 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gjb1P28230 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Gjb1P28230 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gjb1P28230 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gjb1P28230 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gjb1P28230 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gjb1P28230 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gjb1P28230 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gjb1P28230 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gjb1P28230 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Gjb1P28230 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gjb1P28230 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gjb1P28230 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Gjb1P28230 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gjb1P28230 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gjb1P28230 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gjb1P28230 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gjb1P28230 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gjb1P28230 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gjb1P28230 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gjb1P28230 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gjb1P28230 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gjb1P28230 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gjb1P28230 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Gjb1P28230 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gjb1P28230 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Gjb1P28230 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gjb1P28230 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gjb1P28230 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gjb1P28230 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gjb1P28230 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gjb1P28230 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gjb1P28230 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gjb1P28230 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gjb1P28230 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Gjb1P28230 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gjb1P28230 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gjb1P28230 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gjb1P28230 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gjb1P28230 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gjb1P28230 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gjb1P28230 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gjb1P28230 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Gjb1P28230 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gjb1P28230 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gjb1P28230 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gjb1P28230 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gjb1P28230 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gjb1P28230 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gjb1P28230 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gjb1P28230 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gjb1P28230 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gjb1P28230 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gjb1P28230 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gjb1P28230 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gjb1P28230 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gjb1P28230 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gjb1P28230 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gjb1P28230 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gjb1P28230 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gjb1P28230 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gjb1P28230 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gjb1P28230 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gjb1P28230 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gjb1P28230 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gjb1P28230 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gjb1P28230 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gjb1P28230 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gjb1P28230 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gjb1P28230 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gjb1P28230 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gjb1P28230 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gjb1P28230 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gjb1P28230 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gjb1P28230 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms