Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpl3P27659 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpl3P27659 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpl3P27659 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpl3P27659 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpl3P27659 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpl3P27659 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpl3P27659 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpl3P27659 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl3P27659 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl3P27659 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl3P27659 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl3P27659 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl3P27659 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl3P27659 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl3P27659 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl3P27659 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl3P27659 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl3P27659 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl3P27659 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl3P27659 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl3P27659 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl3P27659 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl3P27659 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl3P27659 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl3P27659 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl3P27659 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl3P27659 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl3P27659 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl3P27659 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl3P27659 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl3P27659 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl3P27659 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl3P27659 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl3P27659 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl3P27659 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl3P27659 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl3P27659 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl3P27659 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl3P27659 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl3P27659 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl3P27659 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl3P27659 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl3P27659 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl3P27659 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl3P27659 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl3P27659 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl3P27659 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl3P27659 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl3P27659 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl3P27659 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl3P27659 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl3P27659 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl3P27659 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl3P27659 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl3P27659 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl3P27659 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl3P27659 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl3P27659 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl3P27659 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl3P27659 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl3P27659 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl3P27659 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl3P27659 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl3P27659 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl3P27659 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl3P27659 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rpl3P27659 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpl3P27659 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpl3P27659 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpl3P27659 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpl3P27659 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpl3P27659 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpl3P27659 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpl3P27659 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpl3P27659 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl3P27659 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl3P27659 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl3P27659 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl3P27659 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl3P27659 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl3P27659 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl3P27659 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl3P27659 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl3P27659 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl3P27659 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl3P27659 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl3P27659 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl3P27659 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl3P27659 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl3P27659 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl3P27659 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl3P27659 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl3P27659 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl3P27659 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl3P27659 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl3P27659 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl3P27659 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl3P27659 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpl3P27659 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.4 ms