Protein–RNA interactions for Protein: P24610

Pax3, Paired box protein Pax-3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax3P24610 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pax3P24610 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pax3P24610 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pax3P24610 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pax3P24610 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pax3P24610 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pax3P24610 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Pax3P24610 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pax3P24610 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pax3P24610 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pax3P24610 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pax3P24610 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pax3P24610 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pax3P24610 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pax3P24610 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pax3P24610 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pax3P24610 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pax3P24610 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pax3P24610 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pax3P24610 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pax3P24610 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pax3P24610 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pax3P24610 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pax3P24610 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pax3P24610 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pax3P24610 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Pax3P24610 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pax3P24610 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pax3P24610 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pax3P24610 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pax3P24610 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pax3P24610 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pax3P24610 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pax3P24610 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pax3P24610 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Pax3P24610 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pax3P24610 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pax3P24610 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pax3P24610 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pax3P24610 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pax3P24610 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pax3P24610 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pax3P24610 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pax3P24610 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pax3P24610 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pax3P24610 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pax3P24610 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pax3P24610 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pax3P24610 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pax3P24610 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pax3P24610 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pax3P24610 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pax3P24610 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pax3P24610 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pax3P24610 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pax3P24610 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pax3P24610 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Pax3P24610 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Pax3P24610 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pax3P24610 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pax3P24610 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pax3P24610 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pax3P24610 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pax3P24610 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pax3P24610 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pax3P24610 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pax3P24610 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pax3P24610 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pax3P24610 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pax3P24610 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pax3P24610 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pax3P24610 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pax3P24610 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pax3P24610 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pax3P24610 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pax3P24610 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pax3P24610 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pax3P24610 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pax3P24610 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pax3P24610 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pax3P24610 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pax3P24610 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pax3P24610 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Pax3P24610 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pax3P24610 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pax3P24610 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pax3P24610 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pax3P24610 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pax3P24610 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pax3P24610 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pax3P24610 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pax3P24610 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pax3P24610 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pax3P24610 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pax3P24610 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pax3P24610 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pax3P24610 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pax3P24610 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pax3P24610 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Pax3P24610 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.8 ms