Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lama1P19137 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lama1P19137 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lama1P19137 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lama1P19137 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lama1P19137 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Lama1P19137 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Lama1P19137 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lama1P19137 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lama1P19137 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lama1P19137 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lama1P19137 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Lama1P19137 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lama1P19137 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lama1P19137 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lama1P19137 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lama1P19137 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lama1P19137 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lama1P19137 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lama1P19137 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lama1P19137 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lama1P19137 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lama1P19137 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lama1P19137 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lama1P19137 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lama1P19137 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lama1P19137 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lama1P19137 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lama1P19137 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lama1P19137 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Lama1P19137 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lama1P19137 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Lama1P19137 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lama1P19137 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lama1P19137 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lama1P19137 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lama1P19137 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lama1P19137 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Lama1P19137 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lama1P19137 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lama1P19137 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lama1P19137 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lama1P19137 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lama1P19137 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lama1P19137 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lama1P19137 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lama1P19137 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lama1P19137 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lama1P19137 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lama1P19137 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lama1P19137 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lama1P19137 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lama1P19137 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lama1P19137 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lama1P19137 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lama1P19137 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lama1P19137 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lama1P19137 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lama1P19137 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lama1P19137 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lama1P19137 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Lama1P19137 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lama1P19137 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lama1P19137 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lama1P19137 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lama1P19137 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lama1P19137 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lama1P19137 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lama1P19137 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lama1P19137 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lama1P19137 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lama1P19137 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lama1P19137 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lama1P19137 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lama1P19137 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lama1P19137 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lama1P19137 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lama1P19137 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lama1P19137 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Lama1P19137 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lama1P19137 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lama1P19137 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lama1P19137 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lama1P19137 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lama1P19137 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Lama1P19137 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lama1P19137 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lama1P19137 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lama1P19137 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lama1P19137 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lama1P19137 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lama1P19137 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lama1P19137 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lama1P19137 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lama1P19137 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lama1P19137 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lama1P19137 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lama1P19137 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lama1P19137 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lama1P19137 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms