Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnnc1P19123 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnnc1P19123 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnnc1P19123 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnnc1P19123 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tnnc1P19123 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tnnc1P19123 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tnnc1P19123 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnnc1P19123 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnnc1P19123 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnnc1P19123 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnnc1P19123 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnnc1P19123 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnnc1P19123 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnnc1P19123 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnnc1P19123 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnnc1P19123 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnnc1P19123 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnnc1P19123 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnnc1P19123 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnnc1P19123 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnnc1P19123 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnnc1P19123 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnnc1P19123 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnnc1P19123 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnnc1P19123 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnnc1P19123 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnnc1P19123 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnnc1P19123 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnnc1P19123 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnnc1P19123 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnnc1P19123 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnnc1P19123 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnnc1P19123 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnnc1P19123 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnnc1P19123 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnnc1P19123 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnnc1P19123 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnnc1P19123 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnnc1P19123 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnnc1P19123 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnnc1P19123 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnnc1P19123 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnnc1P19123 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnnc1P19123 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnnc1P19123 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnnc1P19123 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnnc1P19123 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnnc1P19123 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnnc1P19123 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnnc1P19123 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnnc1P19123 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnnc1P19123 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnnc1P19123 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnnc1P19123 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnnc1P19123 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnnc1P19123 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnnc1P19123 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnnc1P19123 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnnc1P19123 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnnc1P19123 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnnc1P19123 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnnc1P19123 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnnc1P19123 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnnc1P19123 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnnc1P19123 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnnc1P19123 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnnc1P19123 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnc1P19123 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnc1P19123 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnc1P19123 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnc1P19123 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnc1P19123 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnc1P19123 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnnc1P19123 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnnc1P19123 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnnc1P19123 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnnc1P19123 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnnc1P19123 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnnc1P19123 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnnc1P19123 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnnc1P19123 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Tnnc1P19123 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnnc1P19123 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnnc1P19123 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnnc1P19123 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnnc1P19123 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnnc1P19123 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnnc1P19123 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnnc1P19123 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnnc1P19123 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnnc1P19123 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnnc1P19123 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnnc1P19123 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnnc1P19123 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnnc1P19123 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnnc1P19123 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnnc1P19123 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnnc1P19123 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnnc1P19123 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms