Protein–RNA interactions for Protein: P18527

Ig heavy chain V region 914, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18527 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,13■□□□□ 0,17
P18527 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16,13■□□□□ 0,17
P18527 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,12■□□□□ 0,17
P18527 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,12■□□□□ 0,17
P18527 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16,12■□□□□ 0,17
P18527 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,12■□□□□ 0,17
P18527 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,12■□□□□ 0,17
P18527 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,12■□□□□ 0,17
P18527 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,11■□□□□ 0,17
P18527 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16,11■□□□□ 0,17
P18527 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,11■□□□□ 0,17
P18527 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16,11■□□□□ 0,17
P18527 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16,11■□□□□ 0,17
P18527 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,11■□□□□ 0,17
P18527 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,1■□□□□ 0,17
P18527 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,1■□□□□ 0,17
P18527 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16,1■□□□□ 0,17
P18527 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16,1■□□□□ 0,17
P18527 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16,1■□□□□ 0,17
P18527 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,1■□□□□ 0,17
P18527 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16,1■□□□□ 0,17
P18527 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
P18527 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16,09■□□□□ 0,17
P18527 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16,09■□□□□ 0,17
P18527 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
P18527 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16,08■□□□□ 0,17
P18527 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,17
P18527 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,17
P18527 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,17
P18527 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,16
P18527 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,16
P18527 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,08■□□□□ 0,16
P18527 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,16
P18527 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16,07■□□□□ 0,16
P18527 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
P18527 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
P18527 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16,07■□□□□ 0,16
P18527 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
P18527 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
P18527 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,06■□□□□ 0,16
P18527 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16,06■□□□□ 0,16
P18527 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,06■□□□□ 0,16
P18527 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16,06■□□□□ 0,16
P18527 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,05■□□□□ 0,16
P18527 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,05■□□□□ 0,16
P18527 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,05■□□□□ 0,16
P18527 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,05■□□□□ 0,16
P18527 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,05■□□□□ 0,16
P18527 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,05■□□□□ 0,16
P18527 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,05■□□□□ 0,16
P18527 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,05■□□□□ 0,16
P18527 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,05■□□□□ 0,16
P18527 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,04■□□□□ 0,16
P18527 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,04■□□□□ 0,16
P18527 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,04■□□□□ 0,16
P18527 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16,04■□□□□ 0,16
P18527 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16,04■□□□□ 0,16
P18527 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16,04■□□□□ 0,16
P18527 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,04■□□□□ 0,16
P18527 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16,03■□□□□ 0,16
P18527 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,03■□□□□ 0,16
P18527 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,03■□□□□ 0,16
P18527 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,03■□□□□ 0,16
P18527 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,03■□□□□ 0,16
P18527 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,03■□□□□ 0,16
P18527 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16,02■□□□□ 0,16
P18527 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16,02■□□□□ 0,16
P18527 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,02■□□□□ 0,15
P18527 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,02■□□□□ 0,15
P18527 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,02■□□□□ 0,15
P18527 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16,01■□□□□ 0,15
P18527 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16,01■□□□□ 0,15
P18527 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16,01■□□□□ 0,15
P18527 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16,01■□□□□ 0,15
P18527 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0,15
P18527 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0,15
P18527 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0,15
P18527 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0,15
P18527 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0,15
P18527 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0,15
P18527 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0,15
P18527 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0,15
P18527 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0,15
P18527 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0,15
P18527 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0,15
P18527 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,99■□□□□ 0,15
P18527 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,99■□□□□ 0,15
P18527 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,99■□□□□ 0,15
P18527 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15,99■□□□□ 0,15
P18527 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15,99■□□□□ 0,15
P18527 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,99■□□□□ 0,15
P18527 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,98■□□□□ 0,15
P18527 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15,98■□□□□ 0,15
P18527 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,98■□□□□ 0,15
P18527 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15,98■□□□□ 0,15
P18527 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,98■□□□□ 0,15
P18527 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,98■□□□□ 0,15
P18527 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15,98■□□□□ 0,15
P18527 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,97■□□□□ 0,15
P18527 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15,97■□□□□ 0,15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30,1 ms