Protein–RNA interactions for Protein: P15388

Kcnc1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnc1P15388 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnc1P15388 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnc1P15388 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnc1P15388 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnc1P15388 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnc1P15388 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnc1P15388 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnc1P15388 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnc1P15388 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnc1P15388 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnc1P15388 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnc1P15388 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnc1P15388 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnc1P15388 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnc1P15388 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnc1P15388 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnc1P15388 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnc1P15388 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnc1P15388 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnc1P15388 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnc1P15388 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnc1P15388 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnc1P15388 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnc1P15388 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnc1P15388 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnc1P15388 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnc1P15388 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnc1P15388 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnc1P15388 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnc1P15388 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnc1P15388 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnc1P15388 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnc1P15388 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnc1P15388 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnc1P15388 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnc1P15388 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnc1P15388 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnc1P15388 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnc1P15388 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnc1P15388 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnc1P15388 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnc1P15388 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnc1P15388 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnc1P15388 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnc1P15388 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnc1P15388 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Kcnc1P15388 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Kcnc1P15388 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnc1P15388 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnc1P15388 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnc1P15388 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnc1P15388 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnc1P15388 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnc1P15388 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnc1P15388 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnc1P15388 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnc1P15388 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnc1P15388 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnc1P15388 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnc1P15388 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnc1P15388 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnc1P15388 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnc1P15388 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnc1P15388 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnc1P15388 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnc1P15388 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kcnc1P15388 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kcnc1P15388 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnc1P15388 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnc1P15388 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnc1P15388 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnc1P15388 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnc1P15388 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnc1P15388 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnc1P15388 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnc1P15388 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnc1P15388 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnc1P15388 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnc1P15388 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnc1P15388 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnc1P15388 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnc1P15388 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnc1P15388 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnc1P15388 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnc1P15388 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnc1P15388 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnc1P15388 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnc1P15388 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnc1P15388 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnc1P15388 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnc1P15388 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnc1P15388 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnc1P15388 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnc1P15388 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnc1P15388 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kcnc1P15388 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnc1P15388 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnc1P15388 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnc1P15388 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnc1P15388 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms