Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scd1P13516 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scd1P13516 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scd1P13516 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scd1P13516 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scd1P13516 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scd1P13516 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scd1P13516 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scd1P13516 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scd1P13516 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scd1P13516 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scd1P13516 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Scd1P13516 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Scd1P13516 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scd1P13516 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scd1P13516 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scd1P13516 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scd1P13516 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scd1P13516 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scd1P13516 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scd1P13516 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scd1P13516 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scd1P13516 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scd1P13516 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scd1P13516 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scd1P13516 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scd1P13516 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scd1P13516 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scd1P13516 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scd1P13516 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Scd1P13516 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scd1P13516 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Scd1P13516 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scd1P13516 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scd1P13516 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scd1P13516 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scd1P13516 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Scd1P13516 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scd1P13516 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scd1P13516 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scd1P13516 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scd1P13516 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scd1P13516 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scd1P13516 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scd1P13516 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scd1P13516 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scd1P13516 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scd1P13516 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scd1P13516 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scd1P13516 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scd1P13516 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scd1P13516 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scd1P13516 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scd1P13516 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scd1P13516 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Scd1P13516 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scd1P13516 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scd1P13516 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scd1P13516 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scd1P13516 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scd1P13516 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scd1P13516 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scd1P13516 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scd1P13516 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scd1P13516 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scd1P13516 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scd1P13516 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scd1P13516 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scd1P13516 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scd1P13516 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scd1P13516 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scd1P13516 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scd1P13516 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scd1P13516 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scd1P13516 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scd1P13516 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scd1P13516 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scd1P13516 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scd1P13516 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scd1P13516 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scd1P13516 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scd1P13516 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scd1P13516 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scd1P13516 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scd1P13516 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scd1P13516 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scd1P13516 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scd1P13516 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scd1P13516 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scd1P13516 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scd1P13516 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scd1P13516 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scd1P13516 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scd1P13516 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scd1P13516 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scd1P13516 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scd1P13516 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scd1P13516 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scd1P13516 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scd1P13516 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms