Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nid1P10493 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nid1P10493 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nid1P10493 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nid1P10493 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nid1P10493 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nid1P10493 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nid1P10493 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nid1P10493 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nid1P10493 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nid1P10493 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nid1P10493 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nid1P10493 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nid1P10493 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nid1P10493 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nid1P10493 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nid1P10493 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nid1P10493 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nid1P10493 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nid1P10493 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nid1P10493 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nid1P10493 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nid1P10493 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nid1P10493 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nid1P10493 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nid1P10493 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nid1P10493 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nid1P10493 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nid1P10493 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nid1P10493 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nid1P10493 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nid1P10493 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nid1P10493 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nid1P10493 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nid1P10493 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Nid1P10493 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nid1P10493 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nid1P10493 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Nid1P10493 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nid1P10493 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nid1P10493 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nid1P10493 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nid1P10493 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nid1P10493 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nid1P10493 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nid1P10493 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nid1P10493 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nid1P10493 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nid1P10493 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nid1P10493 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nid1P10493 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nid1P10493 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nid1P10493 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nid1P10493 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nid1P10493 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nid1P10493 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nid1P10493 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nid1P10493 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nid1P10493 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nid1P10493 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nid1P10493 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nid1P10493 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nid1P10493 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nid1P10493 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nid1P10493 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nid1P10493 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nid1P10493 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nid1P10493 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nid1P10493 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nid1P10493 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nid1P10493 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nid1P10493 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nid1P10493 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nid1P10493 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nid1P10493 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nid1P10493 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nid1P10493 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nid1P10493 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nid1P10493 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nid1P10493 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Nid1P10493 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nid1P10493 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nid1P10493 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nid1P10493 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nid1P10493 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nid1P10493 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nid1P10493 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nid1P10493 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nid1P10493 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nid1P10493 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nid1P10493 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nid1P10493 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nid1P10493 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nid1P10493 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nid1P10493 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nid1P10493 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nid1P10493 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nid1P10493 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nid1P10493 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nid1P10493 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.1 ms