Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
P10404 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
P10404 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
P10404 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
P10404 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
P10404 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
P10404 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
P10404 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
P10404 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
P10404 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
P10404 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
P10404 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
P10404 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
P10404 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
P10404 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
P10404 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
P10404 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
P10404 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
P10404 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
P10404 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
P10404 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
P10404 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
P10404 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
P10404 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
P10404 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
P10404 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
P10404 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
P10404 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
P10404 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
P10404 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
P10404 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
P10404 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
P10404 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
P10404 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
P10404 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
P10404 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
P10404 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
P10404 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
P10404 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P10404 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
P10404 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
P10404 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
P10404 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
P10404 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
P10404 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P10404 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P10404 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
P10404 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P10404 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P10404 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
P10404 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P10404 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P10404 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P10404 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
P10404 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
P10404 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
P10404 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P10404 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P10404 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
P10404 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P10404 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
P10404 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P10404 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P10404 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
P10404 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P10404 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P10404 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P10404 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
P10404 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P10404 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
P10404 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
P10404 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P10404 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
P10404 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
P10404 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P10404 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P10404 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
P10404 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P10404 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P10404 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P10404 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P10404 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P10404 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P10404 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P10404 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
P10404 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P10404 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P10404 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P10404 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P10404 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P10404 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P10404 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P10404 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P10404 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P10404 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
P10404 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
P10404 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
P10404 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P10404 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
P10404 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms