Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Surf1P09925 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Surf1P09925 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Surf1P09925 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Surf1P09925 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Surf1P09925 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Surf1P09925 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Surf1P09925 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Surf1P09925 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Surf1P09925 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Surf1P09925 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Surf1P09925 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Surf1P09925 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Surf1P09925 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Surf1P09925 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Surf1P09925 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Surf1P09925 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Surf1P09925 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Surf1P09925 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Surf1P09925 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Surf1P09925 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Surf1P09925 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Surf1P09925 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Surf1P09925 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Surf1P09925 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Surf1P09925 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Surf1P09925 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Surf1P09925 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Surf1P09925 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Surf1P09925 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Surf1P09925 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Surf1P09925 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Surf1P09925 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Surf1P09925 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Surf1P09925 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Surf1P09925 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Surf1P09925 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Surf1P09925 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Surf1P09925 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Surf1P09925 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Surf1P09925 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Surf1P09925 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Surf1P09925 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Surf1P09925 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Surf1P09925 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Surf1P09925 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Surf1P09925 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Surf1P09925 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Surf1P09925 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Surf1P09925 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Surf1P09925 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Surf1P09925 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Surf1P09925 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Surf1P09925 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Surf1P09925 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Surf1P09925 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Surf1P09925 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Surf1P09925 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Surf1P09925 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Surf1P09925 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Surf1P09925 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Surf1P09925 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Surf1P09925 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Surf1P09925 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Surf1P09925 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Surf1P09925 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Surf1P09925 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Surf1P09925 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Surf1P09925 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Surf1P09925 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Surf1P09925 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Surf1P09925 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Surf1P09925 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Surf1P09925 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Surf1P09925 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Surf1P09925 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Surf1P09925 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Surf1P09925 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Surf1P09925 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Surf1P09925 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Surf1P09925 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Surf1P09925 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Surf1P09925 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Surf1P09925 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Surf1P09925 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Surf1P09925 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Surf1P09925 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Surf1P09925 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Surf1P09925 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Surf1P09925 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Surf1P09925 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Surf1P09925 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Surf1P09925 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Surf1P09925 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Surf1P09925 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Surf1P09925 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Surf1P09925 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Surf1P09925 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Surf1P09925 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Surf1P09925 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms