Protein–RNA interactions for Protein: P07349

Ifna5, Interferon alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna5P07349 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifna5P07349 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifna5P07349 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifna5P07349 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifna5P07349 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifna5P07349 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifna5P07349 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifna5P07349 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifna5P07349 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifna5P07349 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifna5P07349 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifna5P07349 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifna5P07349 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifna5P07349 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna5P07349 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna5P07349 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna5P07349 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna5P07349 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna5P07349 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifna5P07349 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifna5P07349 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifna5P07349 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifna5P07349 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifna5P07349 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifna5P07349 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifna5P07349 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifna5P07349 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna5P07349 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna5P07349 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna5P07349 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna5P07349 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna5P07349 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna5P07349 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna5P07349 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna5P07349 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna5P07349 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna5P07349 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna5P07349 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna5P07349 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna5P07349 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna5P07349 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna5P07349 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna5P07349 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ifna5P07349 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifna5P07349 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifna5P07349 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifna5P07349 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifna5P07349 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifna5P07349 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifna5P07349 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifna5P07349 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifna5P07349 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifna5P07349 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifna5P07349 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifna5P07349 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifna5P07349 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifna5P07349 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifna5P07349 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifna5P07349 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifna5P07349 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifna5P07349 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifna5P07349 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifna5P07349 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifna5P07349 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifna5P07349 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifna5P07349 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifna5P07349 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifna5P07349 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifna5P07349 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ifna5P07349 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ifna5P07349 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifna5P07349 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifna5P07349 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifna5P07349 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna5P07349 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna5P07349 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna5P07349 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna5P07349 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna5P07349 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifna5P07349 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifna5P07349 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifna5P07349 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifna5P07349 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifna5P07349 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifna5P07349 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifna5P07349 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifna5P07349 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifna5P07349 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifna5P07349 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifna5P07349 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifna5P07349 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifna5P07349 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifna5P07349 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifna5P07349 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna5P07349 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna5P07349 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna5P07349 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna5P07349 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna5P07349 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifna5P07349 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 326.7 ms