Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TtrP07309 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TtrP07309 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TtrP07309 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TtrP07309 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TtrP07309 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TtrP07309 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TtrP07309 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TtrP07309 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TtrP07309 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TtrP07309 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TtrP07309 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TtrP07309 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TtrP07309 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TtrP07309 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtrP07309 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TtrP07309 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtrP07309 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtrP07309 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtrP07309 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtrP07309 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtrP07309 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtrP07309 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtrP07309 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtrP07309 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TtrP07309 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TtrP07309 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TtrP07309 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TtrP07309 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TtrP07309 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TtrP07309 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtrP07309 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtrP07309 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TtrP07309 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TtrP07309 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TtrP07309 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TtrP07309 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtrP07309 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtrP07309 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtrP07309 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtrP07309 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TtrP07309 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TtrP07309 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TtrP07309 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TtrP07309 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TtrP07309 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TtrP07309 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TtrP07309 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TtrP07309 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TtrP07309 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TtrP07309 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TtrP07309 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TtrP07309 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TtrP07309 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TtrP07309 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TtrP07309 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TtrP07309 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TtrP07309 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TtrP07309 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TtrP07309 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TtrP07309 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TtrP07309 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TtrP07309 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TtrP07309 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TtrP07309 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TtrP07309 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TtrP07309 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TtrP07309 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TtrP07309 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TtrP07309 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TtrP07309 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TtrP07309 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TtrP07309 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TtrP07309 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TtrP07309 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TtrP07309 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TtrP07309 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TtrP07309 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TtrP07309 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TtrP07309 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TtrP07309 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TtrP07309 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TtrP07309 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtrP07309 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtrP07309 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtrP07309 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtrP07309 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TtrP07309 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtrP07309 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtrP07309 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtrP07309 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtrP07309 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TtrP07309 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TtrP07309 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TtrP07309 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TtrP07309 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TtrP07309 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtrP07309 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtrP07309 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtrP07309 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms