Protein–RNA interactions for Protein: P06328

Ig heavy chain V region VH558 B4, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06328 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P06328 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06328 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P06328 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06328 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P06328 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06328 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06328 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06328 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06328 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06328 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06328 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06328 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06328 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06328 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06328 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06328 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06328 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06328 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06328 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06328 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06328 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06328 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06328 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06328 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06328 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06328 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06328 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06328 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06328 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06328 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06328 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06328 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06328 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06328 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06328 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06328 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06328 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06328 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06328 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06328 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06328 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06328 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06328 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06328 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P06328 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P06328 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06328 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06328 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06328 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06328 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06328 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06328 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06328 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06328 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06328 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06328 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06328 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06328 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06328 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06328 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P06328 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06328 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06328 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06328 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06328 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06328 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06328 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06328 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06328 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06328 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06328 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06328 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06328 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06328 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P06328 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P06328 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
P06328 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06328 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06328 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06328 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06328 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06328 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06328 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06328 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06328 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06328 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06328 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P06328 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06328 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06328 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06328 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06328 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06328 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06328 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06328 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06328 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06328 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06328 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06328 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112 ms