Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Lamc1P02468 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Lamc1P02468 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Lamc1P02468 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Lamc1P02468 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Lamc1P02468 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Lamc1P02468 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Lamc1P02468 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Lamc1P02468 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Lamc1P02468 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Lamc1P02468 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Lamc1P02468 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Lamc1P02468 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Lamc1P02468 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Lamc1P02468 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Lamc1P02468 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Lamc1P02468 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Lamc1P02468 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Lamc1P02468 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Lamc1P02468 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Lamc1P02468 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Lamc1P02468 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Lamc1P02468 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Lamc1P02468 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
Lamc1P02468 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Lamc1P02468 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Lamc1P02468 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Lamc1P02468 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Lamc1P02468 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Lamc1P02468 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Lamc1P02468 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Lamc1P02468 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Lamc1P02468 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Lamc1P02468 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Lamc1P02468 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Lamc1P02468 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Lamc1P02468 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Lamc1P02468 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Lamc1P02468 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Lamc1P02468 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Lamc1P02468 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Lamc1P02468 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Lamc1P02468 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Lamc1P02468 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Lamc1P02468 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Lamc1P02468 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Lamc1P02468 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Lamc1P02468 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Lamc1P02468 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Lamc1P02468 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Lamc1P02468 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Lamc1P02468 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Lamc1P02468 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Lamc1P02468 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Lamc1P02468 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Lamc1P02468 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Lamc1P02468 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Lamc1P02468 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Lamc1P02468 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Lamc1P02468 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Lamc1P02468 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Lamc1P02468 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Lamc1P02468 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Lamc1P02468 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Lamc1P02468 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Lamc1P02468 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Lamc1P02468 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Lamc1P02468 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Lamc1P02468 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Lamc1P02468 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Lamc1P02468 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Lamc1P02468 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Lamc1P02468 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
Lamc1P02468 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Lamc1P02468 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Lamc1P02468 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Lamc1P02468 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Lamc1P02468 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Lamc1P02468 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Lamc1P02468 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Lamc1P02468 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Lamc1P02468 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Lamc1P02468 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Lamc1P02468 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Lamc1P02468 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Lamc1P02468 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Lamc1P02468 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Lamc1P02468 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Lamc1P02468 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Lamc1P02468 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Lamc1P02468 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Lamc1P02468 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Lamc1P02468 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Lamc1P02468 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Lamc1P02468 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Lamc1P02468 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Lamc1P02468 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Lamc1P02468 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Lamc1P02468 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Lamc1P02468 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms