Protein–RNA interactions for Protein: P01791

Ig heavy chain V region HPCM6, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01791 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01791 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01791 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01791 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01791 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01791 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01791 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P01791 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01791 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01791 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01791 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01791 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01791 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01791 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01791 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01791 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01791 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01791 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01791 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01791 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01791 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01791 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01791 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01791 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01791 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01791 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01791 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01791 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P01791 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01791 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01791 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01791 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01791 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01791 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01791 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
P01791 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01791 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01791 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01791 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01791 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
P01791 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01791 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01791 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01791 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01791 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01791 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01791 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01791 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01791 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01791 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01791 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01791 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01791 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01791 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01791 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01791 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01791 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01791 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01791 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01791 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01791 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01791 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01791 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01791 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
P01791 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01791 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01791 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01791 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01791 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01791 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01791 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01791 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01791 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01791 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01791 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01791 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01791 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01791 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01791 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01791 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01791 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01791 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01791 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01791 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01791 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01791 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01791 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01791 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01791 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01791 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01791 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01791 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01791 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01791 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01791 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01791 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01791 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01791 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01791 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01791 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms