Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mtatp6P00848 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mtatp6P00848 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mtatp6P00848 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mtatp6P00848 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mtatp6P00848 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mtatp6P00848 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mtatp6P00848 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mtatp6P00848 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mtatp6P00848 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mtatp6P00848 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mtatp6P00848 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Mtatp6P00848 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mtatp6P00848 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mtatp6P00848 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Mtatp6P00848 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mtatp6P00848 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mtatp6P00848 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mtatp6P00848 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mtatp6P00848 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mtatp6P00848 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mtatp6P00848 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mtatp6P00848 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mtatp6P00848 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mtatp6P00848 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mtatp6P00848 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mtatp6P00848 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mtatp6P00848 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mtatp6P00848 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mtatp6P00848 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mtatp6P00848 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mtatp6P00848 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mtatp6P00848 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mtatp6P00848 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mtatp6P00848 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mtatp6P00848 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mtatp6P00848 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mtatp6P00848 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mtatp6P00848 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mtatp6P00848 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mtatp6P00848 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mtatp6P00848 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mtatp6P00848 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mtatp6P00848 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mtatp6P00848 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mtatp6P00848 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mtatp6P00848 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mtatp6P00848 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Mtatp6P00848 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mtatp6P00848 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mtatp6P00848 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mtatp6P00848 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mtatp6P00848 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Mtatp6P00848 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mtatp6P00848 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mtatp6P00848 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mtatp6P00848 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mtatp6P00848 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mtatp6P00848 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mtatp6P00848 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mtatp6P00848 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mtatp6P00848 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mtatp6P00848 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mtatp6P00848 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mtatp6P00848 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mtatp6P00848 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Mtatp6P00848 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Mtatp6P00848 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mtatp6P00848 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mtatp6P00848 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mtatp6P00848 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mtatp6P00848 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mtatp6P00848 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Mtatp6P00848 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mtatp6P00848 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mtatp6P00848 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mtatp6P00848 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mtatp6P00848 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mtatp6P00848 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mtatp6P00848 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mtatp6P00848 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mtatp6P00848 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mtatp6P00848 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mtatp6P00848 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mtatp6P00848 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mtatp6P00848 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mtatp6P00848 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mtatp6P00848 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mtatp6P00848 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mtatp6P00848 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mtatp6P00848 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mtatp6P00848 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mtatp6P00848 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mtatp6P00848 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mtatp6P00848 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mtatp6P00848 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mtatp6P00848 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mtatp6P00848 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mtatp6P00848 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mtatp6P00848 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms