Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casp8O89110 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casp8O89110 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casp8O89110 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casp8O89110 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casp8O89110 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casp8O89110 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casp8O89110 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp8O89110 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp8O89110 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp8O89110 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp8O89110 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp8O89110 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Casp8O89110 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Casp8O89110 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Casp8O89110 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Casp8O89110 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Casp8O89110 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Casp8O89110 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casp8O89110 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casp8O89110 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casp8O89110 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casp8O89110 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Casp8O89110 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casp8O89110 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casp8O89110 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casp8O89110 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casp8O89110 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casp8O89110 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casp8O89110 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casp8O89110 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casp8O89110 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casp8O89110 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casp8O89110 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casp8O89110 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casp8O89110 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casp8O89110 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casp8O89110 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casp8O89110 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Casp8O89110 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casp8O89110 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Casp8O89110 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casp8O89110 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casp8O89110 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casp8O89110 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casp8O89110 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casp8O89110 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casp8O89110 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casp8O89110 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casp8O89110 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casp8O89110 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Casp8O89110 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casp8O89110 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casp8O89110 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casp8O89110 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casp8O89110 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casp8O89110 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casp8O89110 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casp8O89110 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casp8O89110 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Casp8O89110 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casp8O89110 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casp8O89110 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casp8O89110 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Casp8O89110 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Casp8O89110 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casp8O89110 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casp8O89110 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casp8O89110 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casp8O89110 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Casp8O89110 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casp8O89110 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casp8O89110 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casp8O89110 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casp8O89110 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casp8O89110 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casp8O89110 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casp8O89110 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp8O89110 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp8O89110 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp8O89110 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp8O89110 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp8O89110 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp8O89110 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp8O89110 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp8O89110 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp8O89110 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp8O89110 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp8O89110 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp8O89110 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp8O89110 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp8O89110 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp8O89110 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp8O89110 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casp8O89110 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casp8O89110 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casp8O89110 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casp8O89110 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casp8O89110 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casp8O89110 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms