Protein–RNA interactions for Protein: O89001

Cpd, Carboxypeptidase D, mousemouse

Predictions only

Length 1,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpdO89001 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CpdO89001 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CpdO89001 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CpdO89001 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CpdO89001 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CpdO89001 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CpdO89001 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CpdO89001 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CpdO89001 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CpdO89001 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CpdO89001 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CpdO89001 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CpdO89001 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CpdO89001 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CpdO89001 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CpdO89001 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CpdO89001 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CpdO89001 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CpdO89001 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CpdO89001 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CpdO89001 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CpdO89001 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CpdO89001 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CpdO89001 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CpdO89001 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CpdO89001 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CpdO89001 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CpdO89001 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CpdO89001 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CpdO89001 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CpdO89001 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CpdO89001 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CpdO89001 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CpdO89001 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CpdO89001 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CpdO89001 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CpdO89001 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CpdO89001 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CpdO89001 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CpdO89001 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CpdO89001 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CpdO89001 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CpdO89001 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CpdO89001 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CpdO89001 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CpdO89001 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CpdO89001 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CpdO89001 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CpdO89001 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CpdO89001 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CpdO89001 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CpdO89001 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CpdO89001 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CpdO89001 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CpdO89001 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CpdO89001 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CpdO89001 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CpdO89001 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CpdO89001 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CpdO89001 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CpdO89001 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CpdO89001 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CpdO89001 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CpdO89001 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CpdO89001 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CpdO89001 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CpdO89001 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CpdO89001 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CpdO89001 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CpdO89001 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CpdO89001 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CpdO89001 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CpdO89001 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CpdO89001 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CpdO89001 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CpdO89001 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CpdO89001 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CpdO89001 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CpdO89001 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CpdO89001 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CpdO89001 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CpdO89001 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CpdO89001 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CpdO89001 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CpdO89001 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CpdO89001 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CpdO89001 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CpdO89001 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CpdO89001 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CpdO89001 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CpdO89001 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CpdO89001 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CpdO89001 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CpdO89001 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CpdO89001 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CpdO89001 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CpdO89001 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CpdO89001 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CpdO89001 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CpdO89001 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms