Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Sema3fO88632 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sema3fO88632 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sema3fO88632 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Sema3fO88632 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sema3fO88632 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sema3fO88632 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sema3fO88632 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sema3fO88632 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sema3fO88632 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sema3fO88632 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sema3fO88632 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sema3fO88632 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sema3fO88632 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sema3fO88632 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sema3fO88632 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sema3fO88632 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sema3fO88632 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sema3fO88632 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sema3fO88632 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sema3fO88632 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sema3fO88632 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sema3fO88632 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sema3fO88632 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sema3fO88632 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sema3fO88632 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sema3fO88632 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sema3fO88632 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sema3fO88632 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sema3fO88632 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sema3fO88632 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sema3fO88632 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sema3fO88632 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sema3fO88632 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sema3fO88632 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Sema3fO88632 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sema3fO88632 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sema3fO88632 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sema3fO88632 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sema3fO88632 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sema3fO88632 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sema3fO88632 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sema3fO88632 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sema3fO88632 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sema3fO88632 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sema3fO88632 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sema3fO88632 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sema3fO88632 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sema3fO88632 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sema3fO88632 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sema3fO88632 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sema3fO88632 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sema3fO88632 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sema3fO88632 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sema3fO88632 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sema3fO88632 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sema3fO88632 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sema3fO88632 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sema3fO88632 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sema3fO88632 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Sema3fO88632 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sema3fO88632 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sema3fO88632 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sema3fO88632 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sema3fO88632 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sema3fO88632 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sema3fO88632 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sema3fO88632 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sema3fO88632 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sema3fO88632 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sema3fO88632 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sema3fO88632 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sema3fO88632 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sema3fO88632 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sema3fO88632 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sema3fO88632 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sema3fO88632 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sema3fO88632 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sema3fO88632 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Sema3fO88632 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sema3fO88632 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sema3fO88632 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sema3fO88632 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sema3fO88632 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sema3fO88632 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sema3fO88632 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sema3fO88632 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sema3fO88632 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sema3fO88632 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sema3fO88632 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sema3fO88632 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sema3fO88632 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Sema3fO88632 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sema3fO88632 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sema3fO88632 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sema3fO88632 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sema3fO88632 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sema3fO88632 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sema3fO88632 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Sema3fO88632 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms