Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DffaO54786 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DffaO54786 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DffaO54786 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DffaO54786 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DffaO54786 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DffaO54786 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DffaO54786 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DffaO54786 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DffaO54786 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DffaO54786 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DffaO54786 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DffaO54786 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DffaO54786 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DffaO54786 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DffaO54786 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DffaO54786 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DffaO54786 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DffaO54786 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DffaO54786 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DffaO54786 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DffaO54786 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DffaO54786 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DffaO54786 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DffaO54786 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DffaO54786 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DffaO54786 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DffaO54786 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DffaO54786 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DffaO54786 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DffaO54786 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DffaO54786 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DffaO54786 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DffaO54786 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DffaO54786 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DffaO54786 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DffaO54786 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DffaO54786 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DffaO54786 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DffaO54786 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DffaO54786 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DffaO54786 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DffaO54786 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DffaO54786 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DffaO54786 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DffaO54786 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DffaO54786 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DffaO54786 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DffaO54786 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DffaO54786 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DffaO54786 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DffaO54786 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DffaO54786 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DffaO54786 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DffaO54786 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DffaO54786 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DffaO54786 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DffaO54786 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DffaO54786 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DffaO54786 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DffaO54786 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DffaO54786 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DffaO54786 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DffaO54786 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DffaO54786 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DffaO54786 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DffaO54786 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DffaO54786 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DffaO54786 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DffaO54786 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DffaO54786 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DffaO54786 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DffaO54786 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DffaO54786 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DffaO54786 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DffaO54786 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DffaO54786 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DffaO54786 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DffaO54786 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DffaO54786 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DffaO54786 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DffaO54786 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DffaO54786 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DffaO54786 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DffaO54786 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DffaO54786 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DffaO54786 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DffaO54786 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DffaO54786 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DffaO54786 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DffaO54786 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DffaO54786 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DffaO54786 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DffaO54786 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DffaO54786 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DffaO54786 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DffaO54786 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DffaO54786 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DffaO54786 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DffaO54786 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms