Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnd2O35927 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnnd2O35927 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnnd2O35927 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnnd2O35927 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnnd2O35927 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnnd2O35927 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnnd2O35927 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnnd2O35927 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnnd2O35927 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnnd2O35927 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnnd2O35927 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnnd2O35927 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnnd2O35927 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnnd2O35927 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnnd2O35927 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnnd2O35927 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnnd2O35927 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnnd2O35927 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnnd2O35927 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnd2O35927 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnd2O35927 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnd2O35927 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnd2O35927 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnnd2O35927 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnnd2O35927 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnnd2O35927 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnnd2O35927 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnnd2O35927 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnnd2O35927 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnnd2O35927 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnnd2O35927 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnnd2O35927 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnnd2O35927 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnnd2O35927 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnnd2O35927 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnnd2O35927 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnnd2O35927 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnnd2O35927 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnnd2O35927 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnnd2O35927 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ctnnd2O35927 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnnd2O35927 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnnd2O35927 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnnd2O35927 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnnd2O35927 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnnd2O35927 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnnd2O35927 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnnd2O35927 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnnd2O35927 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnnd2O35927 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnnd2O35927 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctnnd2O35927 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctnnd2O35927 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctnnd2O35927 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctnnd2O35927 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnnd2O35927 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnnd2O35927 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnnd2O35927 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnnd2O35927 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnnd2O35927 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnnd2O35927 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnnd2O35927 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnnd2O35927 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnnd2O35927 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnnd2O35927 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnnd2O35927 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnnd2O35927 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ctnnd2O35927 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ctnnd2O35927 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctnnd2O35927 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctnnd2O35927 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctnnd2O35927 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnnd2O35927 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnnd2O35927 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnnd2O35927 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnnd2O35927 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnnd2O35927 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnnd2O35927 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnnd2O35927 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnnd2O35927 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnnd2O35927 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnnd2O35927 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnnd2O35927 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnnd2O35927 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnnd2O35927 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnnd2O35927 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnnd2O35927 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnd2O35927 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnd2O35927 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnd2O35927 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnd2O35927 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnd2O35927 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnnd2O35927 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnnd2O35927 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnnd2O35927 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnnd2O35927 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnnd2O35927 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnnd2O35927 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctnnd2O35927 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms