Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NudcO35685 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
NudcO35685 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NudcO35685 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NudcO35685 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NudcO35685 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NudcO35685 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
NudcO35685 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NudcO35685 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NudcO35685 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NudcO35685 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NudcO35685 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NudcO35685 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NudcO35685 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NudcO35685 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NudcO35685 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NudcO35685 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NudcO35685 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NudcO35685 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NudcO35685 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NudcO35685 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NudcO35685 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NudcO35685 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NudcO35685 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NudcO35685 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NudcO35685 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NudcO35685 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NudcO35685 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
NudcO35685 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NudcO35685 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NudcO35685 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NudcO35685 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NudcO35685 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NudcO35685 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NudcO35685 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NudcO35685 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NudcO35685 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NudcO35685 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NudcO35685 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NudcO35685 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NudcO35685 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NudcO35685 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NudcO35685 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NudcO35685 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NudcO35685 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NudcO35685 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NudcO35685 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NudcO35685 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NudcO35685 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NudcO35685 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NudcO35685 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NudcO35685 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NudcO35685 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NudcO35685 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NudcO35685 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NudcO35685 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NudcO35685 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NudcO35685 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
NudcO35685 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NudcO35685 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NudcO35685 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NudcO35685 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NudcO35685 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NudcO35685 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NudcO35685 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NudcO35685 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NudcO35685 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NudcO35685 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NudcO35685 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NudcO35685 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NudcO35685 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NudcO35685 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NudcO35685 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NudcO35685 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NudcO35685 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NudcO35685 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NudcO35685 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NudcO35685 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NudcO35685 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NudcO35685 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NudcO35685 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NudcO35685 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NudcO35685 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NudcO35685 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NudcO35685 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NudcO35685 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NudcO35685 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NudcO35685 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NudcO35685 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NudcO35685 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NudcO35685 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NudcO35685 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NudcO35685 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NudcO35685 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
NudcO35685 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NudcO35685 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NudcO35685 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NudcO35685 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NudcO35685 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NudcO35685 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms