Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh2d1bO35324 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh2d1bO35324 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh2d1bO35324 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh2d1bO35324 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sh2d1bO35324 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh2d1bO35324 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh2d1bO35324 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh2d1bO35324 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh2d1bO35324 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh2d1bO35324 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh2d1bO35324 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh2d1bO35324 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh2d1bO35324 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh2d1bO35324 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh2d1bO35324 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh2d1bO35324 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh2d1bO35324 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh2d1bO35324 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh2d1bO35324 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh2d1bO35324 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh2d1bO35324 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh2d1bO35324 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh2d1bO35324 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh2d1bO35324 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh2d1bO35324 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh2d1bO35324 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh2d1bO35324 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh2d1bO35324 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh2d1bO35324 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh2d1bO35324 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh2d1bO35324 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh2d1bO35324 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh2d1bO35324 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh2d1bO35324 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh2d1bO35324 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh2d1bO35324 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh2d1bO35324 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh2d1bO35324 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh2d1bO35324 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh2d1bO35324 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh2d1bO35324 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh2d1bO35324 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh2d1bO35324 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh2d1bO35324 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh2d1bO35324 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh2d1bO35324 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh2d1bO35324 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh2d1bO35324 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh2d1bO35324 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh2d1bO35324 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh2d1bO35324 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh2d1bO35324 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh2d1bO35324 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh2d1bO35324 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh2d1bO35324 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh2d1bO35324 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh2d1bO35324 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh2d1bO35324 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh2d1bO35324 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh2d1bO35324 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh2d1bO35324 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh2d1bO35324 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh2d1bO35324 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh2d1bO35324 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh2d1bO35324 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh2d1bO35324 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh2d1bO35324 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh2d1bO35324 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh2d1bO35324 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh2d1bO35324 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh2d1bO35324 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh2d1bO35324 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh2d1bO35324 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh2d1bO35324 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh2d1bO35324 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh2d1bO35324 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh2d1bO35324 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh2d1bO35324 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh2d1bO35324 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh2d1bO35324 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh2d1bO35324 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh2d1bO35324 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sh2d1bO35324 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh2d1bO35324 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh2d1bO35324 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Sh2d1bO35324 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Sh2d1bO35324 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sh2d1bO35324 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh2d1bO35324 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh2d1bO35324 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh2d1bO35324 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh2d1bO35324 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh2d1bO35324 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh2d1bO35324 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sh2d1bO35324 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh2d1bO35324 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh2d1bO35324 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sh2d1bO35324 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh2d1bO35324 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.9 ms