Protein–RNA interactions for Protein: O08688

Capn5, Calpain-5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn5O08688 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capn5O08688 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capn5O08688 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Capn5O08688 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capn5O08688 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn5O08688 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn5O08688 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn5O08688 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn5O08688 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn5O08688 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capn5O08688 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capn5O08688 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn5O08688 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn5O08688 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn5O08688 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn5O08688 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn5O08688 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn5O08688 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn5O08688 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Capn5O08688 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Capn5O08688 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Capn5O08688 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Capn5O08688 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Capn5O08688 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Capn5O08688 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Capn5O08688 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn5O08688 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn5O08688 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn5O08688 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn5O08688 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn5O08688 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn5O08688 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn5O08688 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn5O08688 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn5O08688 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn5O08688 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn5O08688 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn5O08688 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn5O08688 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Capn5O08688 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Capn5O08688 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Capn5O08688 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capn5O08688 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Capn5O08688 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Capn5O08688 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capn5O08688 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capn5O08688 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn5O08688 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn5O08688 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn5O08688 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn5O08688 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn5O08688 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn5O08688 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn5O08688 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn5O08688 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn5O08688 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn5O08688 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn5O08688 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn5O08688 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn5O08688 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn5O08688 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn5O08688 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn5O08688 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn5O08688 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn5O08688 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn5O08688 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn5O08688 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn5O08688 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn5O08688 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn5O08688 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn5O08688 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn5O08688 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn5O08688 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn5O08688 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn5O08688 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn5O08688 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn5O08688 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn5O08688 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn5O08688 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn5O08688 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn5O08688 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn5O08688 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn5O08688 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn5O08688 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Capn5O08688 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn5O08688 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn5O08688 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn5O08688 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn5O08688 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn5O08688 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn5O08688 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn5O08688 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn5O08688 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn5O08688 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn5O08688 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn5O08688 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn5O08688 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn5O08688 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn5O08688 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn5O08688 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms