Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema3aO08665 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema3aO08665 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema3aO08665 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sema3aO08665 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema3aO08665 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Sema3aO08665 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sema3aO08665 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sema3aO08665 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema3aO08665 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema3aO08665 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema3aO08665 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema3aO08665 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema3aO08665 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema3aO08665 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema3aO08665 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema3aO08665 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema3aO08665 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema3aO08665 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema3aO08665 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema3aO08665 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema3aO08665 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema3aO08665 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema3aO08665 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema3aO08665 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema3aO08665 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema3aO08665 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema3aO08665 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema3aO08665 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Sema3aO08665 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema3aO08665 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema3aO08665 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3aO08665 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3aO08665 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3aO08665 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3aO08665 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3aO08665 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema3aO08665 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema3aO08665 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema3aO08665 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema3aO08665 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema3aO08665 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema3aO08665 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema3aO08665 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema3aO08665 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema3aO08665 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema3aO08665 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3aO08665 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3aO08665 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3aO08665 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3aO08665 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sema3aO08665 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sema3aO08665 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sema3aO08665 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema3aO08665 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema3aO08665 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema3aO08665 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema3aO08665 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema3aO08665 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema3aO08665 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema3aO08665 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema3aO08665 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema3aO08665 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema3aO08665 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema3aO08665 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema3aO08665 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema3aO08665 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema3aO08665 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema3aO08665 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema3aO08665 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema3aO08665 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema3aO08665 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema3aO08665 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema3aO08665 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema3aO08665 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema3aO08665 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema3aO08665 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema3aO08665 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema3aO08665 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema3aO08665 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema3aO08665 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema3aO08665 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sema3aO08665 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema3aO08665 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema3aO08665 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema3aO08665 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema3aO08665 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema3aO08665 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema3aO08665 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema3aO08665 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema3aO08665 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema3aO08665 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema3aO08665 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema3aO08665 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema3aO08665 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema3aO08665 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema3aO08665 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema3aO08665 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema3aO08665 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema3aO08665 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms