Protein–RNA interactions for Protein: L7N298

Gm3424, Predicted gene 3424, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3424L7N298 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3424L7N298 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3424L7N298 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3424L7N298 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3424L7N298 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3424L7N298 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3424L7N298 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3424L7N298 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3424L7N298 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3424L7N298 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3424L7N298 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3424L7N298 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3424L7N298 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3424L7N298 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3424L7N298 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3424L7N298 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3424L7N298 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3424L7N298 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3424L7N298 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3424L7N298 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3424L7N298 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3424L7N298 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3424L7N298 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3424L7N298 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3424L7N298 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3424L7N298 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3424L7N298 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3424L7N298 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3424L7N298 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3424L7N298 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3424L7N298 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3424L7N298 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3424L7N298 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3424L7N298 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3424L7N298 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3424L7N298 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3424L7N298 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3424L7N298 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3424L7N298 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3424L7N298 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3424L7N298 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3424L7N298 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3424L7N298 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3424L7N298 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3424L7N298 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3424L7N298 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3424L7N298 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3424L7N298 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3424L7N298 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3424L7N298 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3424L7N298 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3424L7N298 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3424L7N298 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3424L7N298 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3424L7N298 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3424L7N298 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3424L7N298 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3424L7N298 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3424L7N298 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3424L7N298 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3424L7N298 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm3424L7N298 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm3424L7N298 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3424L7N298 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3424L7N298 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3424L7N298 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3424L7N298 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3424L7N298 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3424L7N298 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3424L7N298 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3424L7N298 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3424L7N298 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3424L7N298 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3424L7N298 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3424L7N298 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3424L7N298 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3424L7N298 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3424L7N298 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3424L7N298 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3424L7N298 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3424L7N298 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3424L7N298 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3424L7N298 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3424L7N298 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3424L7N298 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3424L7N298 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3424L7N298 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3424L7N298 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3424L7N298 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3424L7N298 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3424L7N298 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm3424L7N298 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm3424L7N298 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm3424L7N298 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3424L7N298 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3424L7N298 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3424L7N298 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3424L7N298 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3424L7N298 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3424L7N298 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms