Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC42,76■■■■■ 4,44
Ccdc180J3QNE4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,76■■■■■ 4,43
Ccdc180J3QNE4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC42,75■■■■■ 4,43
Ccdc180J3QNE4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC42,75■■■■■ 4,43
Ccdc180J3QNE4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42,73■■■■■ 4,43
Ccdc180J3QNE4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,73■■■■■ 4,43
Ccdc180J3QNE4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,72■■■■■ 4,43
Ccdc180J3QNE4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42,71■■■■■ 4,43
Ccdc180J3QNE4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,71■■■■■ 4,43
Ccdc180J3QNE4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC42,7■■■■■ 4,43
Ccdc180J3QNE4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC42,7■■■■■ 4,43
Ccdc180J3QNE4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,7■■■■■ 4,43
Ccdc180J3QNE4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC42,68■■■■■ 4,42
Ccdc180J3QNE4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC42,66■■■■■ 4,42
Ccdc180J3QNE4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,63■■■■■ 4,42
Ccdc180J3QNE4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,63■■■■■ 4,42
Ccdc180J3QNE4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,63■■■■■ 4,41
Ccdc180J3QNE4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,63■■■■■ 4,41
Ccdc180J3QNE4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC42,62■■■■■ 4,41
Ccdc180J3QNE4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42,62■■■■■ 4,41
Ccdc180J3QNE4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC42,62■■■■■ 4,41
Ccdc180J3QNE4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,6■■■■■ 4,41
Ccdc180J3QNE4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC42,6■■■■■ 4,41
Ccdc180J3QNE4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC42,59■■■■■ 4,41
Ccdc180J3QNE4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,58■■■■■ 4,41
Ccdc180J3QNE4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,58■■■■■ 4,41
Ccdc180J3QNE4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,57■■■■■ 4,41
Ccdc180J3QNE4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC42,57■■■■■ 4,4
Ccdc180J3QNE4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC42,56■■■■■ 4,4
Ccdc180J3QNE4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,56■■■■■ 4,4
Ccdc180J3QNE4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC42,55■■■■■ 4,4
Ccdc180J3QNE4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC42,55■■■■■ 4,4
Ccdc180J3QNE4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,55■■■■■ 4,4
Ccdc180J3QNE4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC42,55■■■■■ 4,4
Ccdc180J3QNE4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC42,54■■■■■ 4,4
Ccdc180J3QNE4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42,54■■■■■ 4,4
Ccdc180J3QNE4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,53■■■■■ 4,4
Ccdc180J3QNE4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC42,52■■■■■ 4,4
Ccdc180J3QNE4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,51■■■■■ 4,4
Ccdc180J3QNE4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,51■■■■■ 4,4
Ccdc180J3QNE4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC42,51■■■■■ 4,4
Ccdc180J3QNE4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42,51■■■■■ 4,39
Ccdc180J3QNE4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC42,51■■■■■ 4,39
Ccdc180J3QNE4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC42,51■■■■■ 4,39
Ccdc180J3QNE4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC42,5■■■■■ 4,39
Ccdc180J3QNE4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42,5■■■■■ 4,39
Ccdc180J3QNE4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,5■■■■■ 4,39
Ccdc180J3QNE4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC42,49■■■■■ 4,39
Ccdc180J3QNE4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,49■■■■■ 4,39
Ccdc180J3QNE4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,49■■■■■ 4,39
Ccdc180J3QNE4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42,49■■■■■ 4,39
Ccdc180J3QNE4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,48■■■■■ 4,39
Ccdc180J3QNE4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC42,48■■■■■ 4,39
Ccdc180J3QNE4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,47■■■■■ 4,39
Ccdc180J3QNE4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC42,47■■■■■ 4,39
Ccdc180J3QNE4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,47■■■■■ 4,39
Ccdc180J3QNE4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC42,47■■■■■ 4,39
Ccdc180J3QNE4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,46■■■■■ 4,39
Ccdc180J3QNE4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC42,46■■■■■ 4,39
Ccdc180J3QNE4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC42,44■■■■■ 4,39
Ccdc180J3QNE4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC42,44■■■■■ 4,39
Ccdc180J3QNE4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,44■■■■■ 4,38
Ccdc180J3QNE4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC42,44■■■■■ 4,38
Ccdc180J3QNE4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC42,44■■■■■ 4,38
Ccdc180J3QNE4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC42,44■■■■■ 4,38
Ccdc180J3QNE4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,44■■■■■ 4,38
Ccdc180J3QNE4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC42,43■■■■■ 4,38
Ccdc180J3QNE4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,41■■■■■ 4,38
Ccdc180J3QNE4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC42,41■■■■■ 4,38
Ccdc180J3QNE4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC42,39■■■■■ 4,38
Ccdc180J3QNE4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC42,38■■■■■ 4,38
Ccdc180J3QNE4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,37■■■■■ 4,37
Ccdc180J3QNE4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC42,37■■■■■ 4,37
Ccdc180J3QNE4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC42,37■■■■■ 4,37
Ccdc180J3QNE4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42,34■■■■■ 4,37
Ccdc180J3QNE4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,31■■■■■ 4,36
Ccdc180J3QNE4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42,31■■■■■ 4,36
Ccdc180J3QNE4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,31■■■■■ 4,36
Ccdc180J3QNE4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC42,31■■■■■ 4,36
Ccdc180J3QNE4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42,31■■■■■ 4,36
Ccdc180J3QNE4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC42,31■■■■■ 4,36
Ccdc180J3QNE4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,3■■■■■ 4,36
Ccdc180J3QNE4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC42,28■■■■■ 4,36
Ccdc180J3QNE4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,28■■■■■ 4,36
Ccdc180J3QNE4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,28■■■■■ 4,36
Ccdc180J3QNE4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC42,27■■■■■ 4,36
Ccdc180J3QNE4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,26■■■■■ 4,36
Ccdc180J3QNE4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC42,26■■■■■ 4,36
Ccdc180J3QNE4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC42,25■■■■■ 4,35
Ccdc180J3QNE4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC42,25■■■■■ 4,35
Ccdc180J3QNE4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC42,25■■■■■ 4,35
Ccdc180J3QNE4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC42,25■■■■■ 4,35
Ccdc180J3QNE4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,25■■■■■ 4,35
Ccdc180J3QNE4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,25■■■■■ 4,35
Ccdc180J3QNE4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC42,24■■■■■ 4,35
Ccdc180J3QNE4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC42,24■■■■■ 4,35
Ccdc180J3QNE4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC42,23■■■■■ 4,35
Ccdc180J3QNE4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC42,23■■■■■ 4,35
Ccdc180J3QNE4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC42,22■■■■■ 4,35
Ccdc180J3QNE4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,21■■■■■ 4,35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms