Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm20828J3KMI7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm20828J3KMI7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm20828J3KMI7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm20828J3KMI7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm20828J3KMI7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm20828J3KMI7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm20828J3KMI7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm20828J3KMI7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm20828J3KMI7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm20828J3KMI7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm20828J3KMI7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm20828J3KMI7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm20828J3KMI7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm20828J3KMI7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm20828J3KMI7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm20828J3KMI7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm20828J3KMI7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm20828J3KMI7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm20828J3KMI7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm20828J3KMI7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm20828J3KMI7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm20828J3KMI7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm20828J3KMI7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm20828J3KMI7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm20828J3KMI7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm20828J3KMI7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm20828J3KMI7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm20828J3KMI7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm20828J3KMI7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm20828J3KMI7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm20828J3KMI7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm20828J3KMI7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm20828J3KMI7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm20828J3KMI7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm20828J3KMI7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gm20828J3KMI7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm20828J3KMI7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm20828J3KMI7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm20828J3KMI7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm20828J3KMI7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm20828J3KMI7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm20828J3KMI7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm20828J3KMI7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm20828J3KMI7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm20828J3KMI7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm20828J3KMI7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm20828J3KMI7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm20828J3KMI7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm20828J3KMI7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm20828J3KMI7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm20828J3KMI7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm20828J3KMI7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm20828J3KMI7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm20828J3KMI7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm20828J3KMI7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm20828J3KMI7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm20828J3KMI7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm20828J3KMI7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm20828J3KMI7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm20828J3KMI7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm20828J3KMI7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm20828J3KMI7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm20828J3KMI7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm20828J3KMI7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm20828J3KMI7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm20828J3KMI7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm20828J3KMI7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm20828J3KMI7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm20828J3KMI7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm20828J3KMI7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm20828J3KMI7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm20828J3KMI7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm20828J3KMI7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm20828J3KMI7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm20828J3KMI7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20828J3KMI7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20828J3KMI7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20828J3KMI7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20828J3KMI7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20828J3KMI7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20828J3KMI7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm20828J3KMI7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm20828J3KMI7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm20828J3KMI7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm20828J3KMI7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm20828J3KMI7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm20828J3KMI7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm20828J3KMI7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm20828J3KMI7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm20828J3KMI7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm20828J3KMI7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm20828J3KMI7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm20828J3KMI7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm20828J3KMI7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm20828J3KMI7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm20828J3KMI7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm20828J3KMI7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm20828J3KMI7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20828J3KMI7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
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