Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf148G3X9R7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf148G3X9R7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf148G3X9R7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf148G3X9R7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf148G3X9R7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf148G3X9R7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf148G3X9R7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf148G3X9R7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf148G3X9R7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf148G3X9R7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf148G3X9R7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf148G3X9R7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf148G3X9R7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf148G3X9R7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf148G3X9R7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf148G3X9R7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf148G3X9R7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf148G3X9R7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf148G3X9R7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf148G3X9R7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf148G3X9R7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf148G3X9R7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf148G3X9R7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf148G3X9R7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf148G3X9R7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf148G3X9R7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf148G3X9R7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf148G3X9R7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf148G3X9R7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf148G3X9R7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf148G3X9R7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf148G3X9R7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf148G3X9R7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf148G3X9R7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf148G3X9R7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf148G3X9R7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf148G3X9R7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf148G3X9R7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf148G3X9R7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf148G3X9R7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf148G3X9R7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf148G3X9R7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf148G3X9R7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf148G3X9R7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf148G3X9R7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf148G3X9R7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf148G3X9R7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf148G3X9R7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf148G3X9R7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf148G3X9R7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf148G3X9R7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf148G3X9R7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf148G3X9R7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf148G3X9R7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf148G3X9R7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf148G3X9R7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf148G3X9R7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf148G3X9R7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf148G3X9R7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf148G3X9R7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf148G3X9R7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf148G3X9R7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf148G3X9R7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf148G3X9R7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf148G3X9R7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf148G3X9R7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf148G3X9R7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf148G3X9R7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf148G3X9R7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf148G3X9R7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf148G3X9R7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf148G3X9R7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf148G3X9R7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf148G3X9R7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf148G3X9R7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf148G3X9R7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf148G3X9R7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf148G3X9R7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf148G3X9R7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf148G3X9R7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf148G3X9R7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf148G3X9R7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf148G3X9R7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf148G3X9R7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf148G3X9R7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf148G3X9R7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf148G3X9R7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf148G3X9R7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf148G3X9R7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf148G3X9R7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf148G3X9R7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf148G3X9R7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf148G3X9R7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf148G3X9R7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf148G3X9R7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf148G3X9R7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf148G3X9R7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf148G3X9R7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf148G3X9R7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms