Protein–RNA interactions for Protein: G3UW87

Gm17455, MCG55969, mousemouse

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Length 128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17455G3UW87 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17455G3UW87 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17455G3UW87 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17455G3UW87 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17455G3UW87 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17455G3UW87 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17455G3UW87 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17455G3UW87 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17455G3UW87 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17455G3UW87 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17455G3UW87 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17455G3UW87 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17455G3UW87 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17455G3UW87 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17455G3UW87 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17455G3UW87 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17455G3UW87 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17455G3UW87 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17455G3UW87 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17455G3UW87 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17455G3UW87 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17455G3UW87 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17455G3UW87 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17455G3UW87 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17455G3UW87 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17455G3UW87 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17455G3UW87 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm17455G3UW87 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm17455G3UW87 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm17455G3UW87 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm17455G3UW87 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm17455G3UW87 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17455G3UW87 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17455G3UW87 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17455G3UW87 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17455G3UW87 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17455G3UW87 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17455G3UW87 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm17455G3UW87 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm17455G3UW87 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm17455G3UW87 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm17455G3UW87 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm17455G3UW87 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm17455G3UW87 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm17455G3UW87 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm17455G3UW87 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm17455G3UW87 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm17455G3UW87 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm17455G3UW87 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm17455G3UW87 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm17455G3UW87 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm17455G3UW87 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm17455G3UW87 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm17455G3UW87 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm17455G3UW87 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm17455G3UW87 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm17455G3UW87 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm17455G3UW87 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm17455G3UW87 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm17455G3UW87 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm17455G3UW87 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm17455G3UW87 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm17455G3UW87 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm17455G3UW87 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm17455G3UW87 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm17455G3UW87 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm17455G3UW87 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm17455G3UW87 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm17455G3UW87 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm17455G3UW87 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm17455G3UW87 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm17455G3UW87 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm17455G3UW87 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm17455G3UW87 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm17455G3UW87 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm17455G3UW87 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm17455G3UW87 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm17455G3UW87 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm17455G3UW87 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm17455G3UW87 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm17455G3UW87 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm17455G3UW87 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm17455G3UW87 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm17455G3UW87 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm17455G3UW87 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm17455G3UW87 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm17455G3UW87 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17455G3UW87 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17455G3UW87 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm17455G3UW87 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm17455G3UW87 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm17455G3UW87 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm17455G3UW87 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm17455G3UW87 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17455G3UW87 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17455G3UW87 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17455G3UW87 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17455G3UW87 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17455G3UW87 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17455G3UW87 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122 ms