Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NpcdF8VQB8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NpcdF8VQB8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NpcdF8VQB8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NpcdF8VQB8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NpcdF8VQB8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NpcdF8VQB8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NpcdF8VQB8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NpcdF8VQB8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NpcdF8VQB8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NpcdF8VQB8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NpcdF8VQB8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NpcdF8VQB8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NpcdF8VQB8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NpcdF8VQB8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NpcdF8VQB8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NpcdF8VQB8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NpcdF8VQB8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NpcdF8VQB8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NpcdF8VQB8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NpcdF8VQB8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NpcdF8VQB8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NpcdF8VQB8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NpcdF8VQB8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NpcdF8VQB8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NpcdF8VQB8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NpcdF8VQB8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NpcdF8VQB8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NpcdF8VQB8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NpcdF8VQB8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NpcdF8VQB8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NpcdF8VQB8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NpcdF8VQB8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NpcdF8VQB8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NpcdF8VQB8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NpcdF8VQB8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NpcdF8VQB8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NpcdF8VQB8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NpcdF8VQB8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NpcdF8VQB8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NpcdF8VQB8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NpcdF8VQB8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NpcdF8VQB8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NpcdF8VQB8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NpcdF8VQB8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NpcdF8VQB8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NpcdF8VQB8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NpcdF8VQB8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NpcdF8VQB8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NpcdF8VQB8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NpcdF8VQB8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NpcdF8VQB8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NpcdF8VQB8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NpcdF8VQB8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NpcdF8VQB8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NpcdF8VQB8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NpcdF8VQB8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NpcdF8VQB8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NpcdF8VQB8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NpcdF8VQB8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NpcdF8VQB8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NpcdF8VQB8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NpcdF8VQB8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NpcdF8VQB8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NpcdF8VQB8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NpcdF8VQB8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NpcdF8VQB8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NpcdF8VQB8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NpcdF8VQB8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NpcdF8VQB8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
NpcdF8VQB8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NpcdF8VQB8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NpcdF8VQB8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NpcdF8VQB8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NpcdF8VQB8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NpcdF8VQB8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NpcdF8VQB8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NpcdF8VQB8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NpcdF8VQB8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NpcdF8VQB8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NpcdF8VQB8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NpcdF8VQB8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NpcdF8VQB8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NpcdF8VQB8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NpcdF8VQB8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NpcdF8VQB8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NpcdF8VQB8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NpcdF8VQB8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NpcdF8VQB8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NpcdF8VQB8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NpcdF8VQB8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NpcdF8VQB8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NpcdF8VQB8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NpcdF8VQB8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NpcdF8VQB8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NpcdF8VQB8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NpcdF8VQB8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NpcdF8VQB8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NpcdF8VQB8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NpcdF8VQB8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms