Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,95■■■■■ 4,15
Ercc6F8VPZ5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,94■■■■■ 4,14
Ercc6F8VPZ5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,94■■■■■ 4,14
Ercc6F8VPZ5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC40,94■■■■■ 4,14
Ercc6F8VPZ5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC40,92■■■■■ 4,14
Ercc6F8VPZ5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC40,91■■■■■ 4,14
Ercc6F8VPZ5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC40,9■■■■■ 4,14
Ercc6F8VPZ5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,9■■■■■ 4,14
Ercc6F8VPZ5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,9■■■■■ 4,14
Ercc6F8VPZ5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,89■■■■■ 4,14
Ercc6F8VPZ5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC40,89■■■■■ 4,14
Ercc6F8VPZ5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC40,89■■■■■ 4,14
Ercc6F8VPZ5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,88■■■■■ 4,13
Ercc6F8VPZ5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,86■■■■■ 4,13
Ercc6F8VPZ5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,86■■■■■ 4,13
Ercc6F8VPZ5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC40,86■■■■■ 4,13
Ercc6F8VPZ5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,85■■■■■ 4,13
Ercc6F8VPZ5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC40,84■■■■■ 4,13
Ercc6F8VPZ5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC40,83■■■■■ 4,13
Ercc6F8VPZ5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,83■■■■■ 4,13
Ercc6F8VPZ5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC40,83■■■■■ 4,13
Ercc6F8VPZ5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,83■■■■■ 4,13
Ercc6F8VPZ5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC40,82■■■■■ 4,13
Ercc6F8VPZ5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,82■■■■■ 4,12
Ercc6F8VPZ5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC40,82■■■■■ 4,12
Ercc6F8VPZ5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC40,81■■■■■ 4,12
Ercc6F8VPZ5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC40,81■■■■■ 4,12
Ercc6F8VPZ5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,8■■■■■ 4,12
Ercc6F8VPZ5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,79■■■■■ 4,12
Ercc6F8VPZ5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,78■■■■■ 4,12
Ercc6F8VPZ5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC40,78■■■■■ 4,12
Ercc6F8VPZ5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,77■■■■■ 4,12
Ercc6F8VPZ5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,77■■■■■ 4,12
Ercc6F8VPZ5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC40,76■■■■■ 4,12
Ercc6F8VPZ5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC40,76■■■■■ 4,12
Ercc6F8VPZ5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,76■■■■■ 4,12
Ercc6F8VPZ5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,75■■■■■ 4,11
Ercc6F8VPZ5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC40,74■■■■■ 4,11
Ercc6F8VPZ5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,74■■■■■ 4,11
Ercc6F8VPZ5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,73■■■■■ 4,11
Ercc6F8VPZ5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,73■■■■■ 4,11
Ercc6F8VPZ5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC40,71■■■■■ 4,11
Ercc6F8VPZ5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,71■■■■■ 4,11
Ercc6F8VPZ5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,71■■■■■ 4,11
Ercc6F8VPZ5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,7■■■■■ 4,11
Ercc6F8VPZ5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC40,69■■■■■ 4,11
Ercc6F8VPZ5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,69■■■■■ 4,1
Ercc6F8VPZ5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,69■■■■■ 4,1
Ercc6F8VPZ5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,68■■■■■ 4,1
Ercc6F8VPZ5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,68■■■■■ 4,1
Ercc6F8VPZ5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,67■■■■■ 4,1
Ercc6F8VPZ5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC40,67■■■■■ 4,1
Ercc6F8VPZ5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40,65■■■■■ 4,1
Ercc6F8VPZ5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,64■■■■■ 4,1
Ercc6F8VPZ5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC40,64■■■■■ 4,1
Ercc6F8VPZ5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC40,64■■■■■ 4,1
Ercc6F8VPZ5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC40,63■■■■■ 4,09
Ercc6F8VPZ5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC40,63■■■■■ 4,09
Ercc6F8VPZ5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,62■■■■■ 4,09
Ercc6F8VPZ5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC40,62■■■■■ 4,09
Ercc6F8VPZ5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40,61■■■■■ 4,09
Ercc6F8VPZ5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC40,61■■■■■ 4,09
Ercc6F8VPZ5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC40,59■■■■■ 4,09
Ercc6F8VPZ5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC40,58■■■■■ 4,09
Ercc6F8VPZ5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC40,58■■■■■ 4,09
Ercc6F8VPZ5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC40,57■■■■■ 4,09
Ercc6F8VPZ5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,57■■■■■ 4,09
Ercc6F8VPZ5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40,57■■■■■ 4,08
Ercc6F8VPZ5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,56■■■■■ 4,08
Ercc6F8VPZ5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40,56■■■■■ 4,08
Ercc6F8VPZ5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,56■■■■■ 4,08
Ercc6F8VPZ5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC40,56■■■■■ 4,08
Ercc6F8VPZ5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40,55■■■■■ 4,08
Ercc6F8VPZ5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,55■■■■■ 4,08
Ercc6F8VPZ5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,54■■■■■ 4,08
Ercc6F8VPZ5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,54■■■■■ 4,08
Ercc6F8VPZ5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC40,53■■■■■ 4,08
Ercc6F8VPZ5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40,52■■■■■ 4,08
Ercc6F8VPZ5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,52■■■■■ 4,08
Ercc6F8VPZ5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC40,51■■■■■ 4,08
Ercc6F8VPZ5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC40,5■■■■■ 4,07
Ercc6F8VPZ5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,5■■■■■ 4,07
Ercc6F8VPZ5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC40,5■■■■■ 4,07
Ercc6F8VPZ5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,49■■■■■ 4,07
Ercc6F8VPZ5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC40,48■■■■■ 4,07
Ercc6F8VPZ5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,46■■■■■ 4,07
Ercc6F8VPZ5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,45■■■■■ 4,07
Ercc6F8VPZ5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,44■■■■■ 4,06
Ercc6F8VPZ5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC40,43■■■■■ 4,06
Ercc6F8VPZ5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,43■■■■■ 4,06
Ercc6F8VPZ5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,42■■■■■ 4,06
Ercc6F8VPZ5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,42■■■■■ 4,06
Ercc6F8VPZ5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,41■■■■■ 4,06
Ercc6F8VPZ5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC40,41■■■■■ 4,06
Ercc6F8VPZ5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC40,4■■■■■ 4,06
Ercc6F8VPZ5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC40,39■■■■■ 4,06
Ercc6F8VPZ5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC40,39■■■■■ 4,06
Ercc6F8VPZ5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40,39■■■■■ 4,06
Ercc6F8VPZ5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,39■■■■■ 4,06
Ercc6F8VPZ5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC40,39■■■■■ 4,06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,3 ms