Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm5160F8VPN3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm5160F8VPN3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm5160F8VPN3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm5160F8VPN3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm5160F8VPN3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm5160F8VPN3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm5160F8VPN3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm5160F8VPN3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm5160F8VPN3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm5160F8VPN3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm5160F8VPN3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm5160F8VPN3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm5160F8VPN3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm5160F8VPN3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm5160F8VPN3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm5160F8VPN3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm5160F8VPN3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm5160F8VPN3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm5160F8VPN3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm5160F8VPN3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm5160F8VPN3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm5160F8VPN3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm5160F8VPN3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm5160F8VPN3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm5160F8VPN3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm5160F8VPN3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm5160F8VPN3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm5160F8VPN3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm5160F8VPN3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm5160F8VPN3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm5160F8VPN3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm5160F8VPN3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm5160F8VPN3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm5160F8VPN3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm5160F8VPN3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm5160F8VPN3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm5160F8VPN3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm5160F8VPN3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm5160F8VPN3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm5160F8VPN3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm5160F8VPN3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm5160F8VPN3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm5160F8VPN3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm5160F8VPN3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm5160F8VPN3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm5160F8VPN3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm5160F8VPN3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm5160F8VPN3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm5160F8VPN3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm5160F8VPN3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm5160F8VPN3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm5160F8VPN3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm5160F8VPN3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm5160F8VPN3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm5160F8VPN3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm5160F8VPN3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm5160F8VPN3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm5160F8VPN3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm5160F8VPN3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm5160F8VPN3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm5160F8VPN3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm5160F8VPN3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm5160F8VPN3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm5160F8VPN3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm5160F8VPN3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gm5160F8VPN3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gm5160F8VPN3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm5160F8VPN3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm5160F8VPN3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm5160F8VPN3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm5160F8VPN3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm5160F8VPN3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm5160F8VPN3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm5160F8VPN3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm5160F8VPN3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm5160F8VPN3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm5160F8VPN3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm5160F8VPN3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm5160F8VPN3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm5160F8VPN3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm5160F8VPN3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm5160F8VPN3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm5160F8VPN3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm5160F8VPN3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm5160F8VPN3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm5160F8VPN3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm5160F8VPN3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm5160F8VPN3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm5160F8VPN3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm5160F8VPN3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm5160F8VPN3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm5160F8VPN3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm5160F8VPN3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm5160F8VPN3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm5160F8VPN3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm5160F8VPN3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm5160F8VPN3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm5160F8VPN3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm5160F8VPN3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms