Protein–RNA interactions for Protein: F7BE40

Arl9, ADP-ribosylation factor-like 9 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl9F7BE40 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arl9F7BE40 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arl9F7BE40 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arl9F7BE40 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arl9F7BE40 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arl9F7BE40 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arl9F7BE40 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arl9F7BE40 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arl9F7BE40 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arl9F7BE40 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arl9F7BE40 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arl9F7BE40 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arl9F7BE40 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arl9F7BE40 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arl9F7BE40 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arl9F7BE40 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arl9F7BE40 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arl9F7BE40 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arl9F7BE40 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arl9F7BE40 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arl9F7BE40 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arl9F7BE40 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Arl9F7BE40 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Arl9F7BE40 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arl9F7BE40 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Arl9F7BE40 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Arl9F7BE40 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arl9F7BE40 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arl9F7BE40 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arl9F7BE40 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arl9F7BE40 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arl9F7BE40 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arl9F7BE40 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arl9F7BE40 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arl9F7BE40 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arl9F7BE40 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arl9F7BE40 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arl9F7BE40 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Arl9F7BE40 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arl9F7BE40 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arl9F7BE40 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arl9F7BE40 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arl9F7BE40 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arl9F7BE40 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arl9F7BE40 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arl9F7BE40 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arl9F7BE40 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arl9F7BE40 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arl9F7BE40 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arl9F7BE40 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arl9F7BE40 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arl9F7BE40 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arl9F7BE40 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arl9F7BE40 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arl9F7BE40 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arl9F7BE40 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arl9F7BE40 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arl9F7BE40 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arl9F7BE40 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arl9F7BE40 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arl9F7BE40 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arl9F7BE40 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arl9F7BE40 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arl9F7BE40 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Arl9F7BE40 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arl9F7BE40 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arl9F7BE40 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arl9F7BE40 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arl9F7BE40 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Arl9F7BE40 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arl9F7BE40 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arl9F7BE40 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arl9F7BE40 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Arl9F7BE40 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arl9F7BE40 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arl9F7BE40 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arl9F7BE40 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arl9F7BE40 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arl9F7BE40 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arl9F7BE40 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arl9F7BE40 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Arl9F7BE40 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arl9F7BE40 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arl9F7BE40 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arl9F7BE40 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Arl9F7BE40 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Arl9F7BE40 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Arl9F7BE40 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arl9F7BE40 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arl9F7BE40 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arl9F7BE40 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arl9F7BE40 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Arl9F7BE40 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arl9F7BE40 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arl9F7BE40 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arl9F7BE40 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arl9F7BE40 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arl9F7BE40 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arl9F7BE40 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arl9F7BE40 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms