Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8N6

Aknad1, AKNA domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aknad1E9Q8N6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Aknad1E9Q8N6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Aknad1E9Q8N6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Aknad1E9Q8N6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Aknad1E9Q8N6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Aknad1E9Q8N6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Aknad1E9Q8N6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Aknad1E9Q8N6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Aknad1E9Q8N6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Aknad1E9Q8N6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Aknad1E9Q8N6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Aknad1E9Q8N6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Aknad1E9Q8N6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Aknad1E9Q8N6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Aknad1E9Q8N6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Aknad1E9Q8N6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Aknad1E9Q8N6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Aknad1E9Q8N6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Aknad1E9Q8N6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Aknad1E9Q8N6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Aknad1E9Q8N6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Aknad1E9Q8N6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Aknad1E9Q8N6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Aknad1E9Q8N6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Aknad1E9Q8N6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Aknad1E9Q8N6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Aknad1E9Q8N6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Aknad1E9Q8N6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Aknad1E9Q8N6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Aknad1E9Q8N6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Aknad1E9Q8N6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Aknad1E9Q8N6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Aknad1E9Q8N6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Aknad1E9Q8N6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Aknad1E9Q8N6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Aknad1E9Q8N6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Aknad1E9Q8N6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Aknad1E9Q8N6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Aknad1E9Q8N6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Aknad1E9Q8N6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Aknad1E9Q8N6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Aknad1E9Q8N6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Aknad1E9Q8N6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Aknad1E9Q8N6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Aknad1E9Q8N6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Aknad1E9Q8N6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Aknad1E9Q8N6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Aknad1E9Q8N6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Aknad1E9Q8N6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Aknad1E9Q8N6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Aknad1E9Q8N6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Aknad1E9Q8N6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Aknad1E9Q8N6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Aknad1E9Q8N6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Aknad1E9Q8N6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Aknad1E9Q8N6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Aknad1E9Q8N6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Aknad1E9Q8N6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Aknad1E9Q8N6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Aknad1E9Q8N6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Aknad1E9Q8N6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Aknad1E9Q8N6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Aknad1E9Q8N6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Aknad1E9Q8N6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Aknad1E9Q8N6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Aknad1E9Q8N6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Aknad1E9Q8N6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Aknad1E9Q8N6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Aknad1E9Q8N6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Aknad1E9Q8N6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Aknad1E9Q8N6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Aknad1E9Q8N6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Aknad1E9Q8N6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Aknad1E9Q8N6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Aknad1E9Q8N6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Aknad1E9Q8N6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Aknad1E9Q8N6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Aknad1E9Q8N6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Aknad1E9Q8N6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Aknad1E9Q8N6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Aknad1E9Q8N6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Aknad1E9Q8N6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Aknad1E9Q8N6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Aknad1E9Q8N6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Aknad1E9Q8N6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Aknad1E9Q8N6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Aknad1E9Q8N6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Aknad1E9Q8N6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Aknad1E9Q8N6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Aknad1E9Q8N6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Aknad1E9Q8N6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Aknad1E9Q8N6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Aknad1E9Q8N6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Aknad1E9Q8N6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Aknad1E9Q8N6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Aknad1E9Q8N6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Aknad1E9Q8N6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Aknad1E9Q8N6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Aknad1E9Q8N6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Aknad1E9Q8N6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms