Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm9972E9Q053 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm9972E9Q053 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm9972E9Q053 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm9972E9Q053 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm9972E9Q053 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm9972E9Q053 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm9972E9Q053 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm9972E9Q053 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm9972E9Q053 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm9972E9Q053 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm9972E9Q053 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm9972E9Q053 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm9972E9Q053 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm9972E9Q053 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm9972E9Q053 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm9972E9Q053 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm9972E9Q053 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm9972E9Q053 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm9972E9Q053 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm9972E9Q053 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm9972E9Q053 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm9972E9Q053 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm9972E9Q053 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm9972E9Q053 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm9972E9Q053 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm9972E9Q053 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm9972E9Q053 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm9972E9Q053 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm9972E9Q053 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm9972E9Q053 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm9972E9Q053 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm9972E9Q053 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm9972E9Q053 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm9972E9Q053 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm9972E9Q053 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm9972E9Q053 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm9972E9Q053 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm9972E9Q053 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm9972E9Q053 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm9972E9Q053 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm9972E9Q053 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm9972E9Q053 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm9972E9Q053 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm9972E9Q053 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm9972E9Q053 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm9972E9Q053 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm9972E9Q053 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm9972E9Q053 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm9972E9Q053 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm9972E9Q053 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm9972E9Q053 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm9972E9Q053 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm9972E9Q053 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm9972E9Q053 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm9972E9Q053 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm9972E9Q053 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm9972E9Q053 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm9972E9Q053 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm9972E9Q053 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm9972E9Q053 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm9972E9Q053 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm9972E9Q053 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm9972E9Q053 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm9972E9Q053 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm9972E9Q053 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm9972E9Q053 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm9972E9Q053 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm9972E9Q053 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm9972E9Q053 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm9972E9Q053 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm9972E9Q053 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm9972E9Q053 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm9972E9Q053 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm9972E9Q053 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm9972E9Q053 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm9972E9Q053 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm9972E9Q053 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm9972E9Q053 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm9972E9Q053 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm9972E9Q053 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm9972E9Q053 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm9972E9Q053 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm9972E9Q053 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm9972E9Q053 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm9972E9Q053 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm9972E9Q053 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm9972E9Q053 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm9972E9Q053 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm9972E9Q053 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm9972E9Q053 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm9972E9Q053 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm9972E9Q053 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm9972E9Q053 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm9972E9Q053 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm9972E9Q053 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm9972E9Q053 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm9972E9Q053 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm9972E9Q053 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm9972E9Q053 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms