Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trim30dE9PWL0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trim30dE9PWL0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trim30dE9PWL0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trim30dE9PWL0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trim30dE9PWL0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trim30dE9PWL0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trim30dE9PWL0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trim30dE9PWL0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trim30dE9PWL0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trim30dE9PWL0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trim30dE9PWL0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trim30dE9PWL0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trim30dE9PWL0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trim30dE9PWL0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trim30dE9PWL0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Trim30dE9PWL0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trim30dE9PWL0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trim30dE9PWL0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trim30dE9PWL0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trim30dE9PWL0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trim30dE9PWL0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trim30dE9PWL0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trim30dE9PWL0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trim30dE9PWL0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trim30dE9PWL0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trim30dE9PWL0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trim30dE9PWL0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trim30dE9PWL0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Trim30dE9PWL0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trim30dE9PWL0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trim30dE9PWL0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trim30dE9PWL0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trim30dE9PWL0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trim30dE9PWL0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Trim30dE9PWL0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim30dE9PWL0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim30dE9PWL0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim30dE9PWL0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim30dE9PWL0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim30dE9PWL0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim30dE9PWL0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim30dE9PWL0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trim30dE9PWL0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim30dE9PWL0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trim30dE9PWL0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trim30dE9PWL0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trim30dE9PWL0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trim30dE9PWL0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim30dE9PWL0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim30dE9PWL0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim30dE9PWL0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim30dE9PWL0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim30dE9PWL0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim30dE9PWL0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim30dE9PWL0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim30dE9PWL0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim30dE9PWL0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim30dE9PWL0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim30dE9PWL0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim30dE9PWL0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim30dE9PWL0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim30dE9PWL0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim30dE9PWL0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim30dE9PWL0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim30dE9PWL0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim30dE9PWL0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trim30dE9PWL0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trim30dE9PWL0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trim30dE9PWL0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trim30dE9PWL0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Trim30dE9PWL0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trim30dE9PWL0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trim30dE9PWL0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trim30dE9PWL0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trim30dE9PWL0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim30dE9PWL0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim30dE9PWL0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim30dE9PWL0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim30dE9PWL0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim30dE9PWL0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim30dE9PWL0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim30dE9PWL0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim30dE9PWL0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim30dE9PWL0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim30dE9PWL0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trim30dE9PWL0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim30dE9PWL0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim30dE9PWL0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim30dE9PWL0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trim30dE9PWL0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trim30dE9PWL0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trim30dE9PWL0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trim30dE9PWL0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trim30dE9PWL0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim30dE9PWL0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim30dE9PWL0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim30dE9PWL0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim30dE9PWL0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim30dE9PWL0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms